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Bacterial single-cell approaches to the relationship between diversity and fucntion in the sea

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Base de données pour les bactéries marines

L'université de Kalmar a mis au point une base de données publique qui contient des informations génétiques et géographiques sur les bactéries marines.

La diversité des espèces est un composant principal de tout écosystème en bonne santé. Cela se remarque en particulier dans l'océan, où les chercheurs se battent pour estimer le nombre et le type de bactérioplancton. Des efforts internationaux pour isoler et identifier les différents types de bactéries sont en cours. Les techniques génétiques ont prouvé leur efficacité et un certain nombre de séquences bactériennes ont déjà été ajoutées à GenBank, la collection publique de toutes les séquences d'acide désoxyribonucléique (ADN). L'université de Kalmar en Suède a extrait toutes les séquences en culture ou non d'acide ribonucléique ribosomal 16S (ARNs 16S) de la GenBank et les a assemblées dans une base de données. La base de données peut être consultée en ligne à l'adresse suivante: http://www.icm.csic.es/bio/projects/basics/(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre). Les microbiologistes marins de Suède ont perfectionné la base de données en y ajoutant des informations concernant l'emplacement géographique de divers types de bactérioplancton. Cet outil unique ouvrira la voie à de nouveaux projets de recherche, ce qui permettra une focalisation régionale ou mondiale. La communauté scientifique devrait participer au maintien et à l'expansion de la base de données au fur et à mesure de la mise à disposition de davantage de séquences d'ARNs 16S.

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