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Spatial/temporal organisation and regulation of the mapk pathway (MAPK SIGNALLING)

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Enfoque para un software que permita entender las MAPK

La quinasa MAP (MAPK) es, tal vez, la vía de señalización más importante a nivel celular implicada en un gran número de procesos biológicos, desde el crecimiento y el desarrollo hasta la patogénesis.

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El proyecto MAPK SIGNALLING, financiado con fondos comunitarios, se propuso aclarar la organización espacio-temporal de esta vía y el modo en que dicha organización influye sobre su funcionamiento. En otras palabras, aunque actualmente los científicos conocen la configuración de la vía, poco se sabe de su implicación en los diferentes procesos. El Instituto Beatson para la Investigación del Cáncer, socio del proyecto, se centró en el desarrollo de las herramientas adecuadas necesarias para el procesamiento de los datos de expresión de proteínas y genes. Estas herramientas forman una parte esencial de los esfuerzos de investigación realizados en el marco del proyecto, dada la cantidad de información que es necesario procesar e interpretar. Los investigadores trataron de identificar las proteínas que pueden emplearse para estudiar la expresión de las proteínas utilizando geles bidimensionales (2D). El objetivo general era elaborar un modelo de la vía MAPK usando estos datos proteómicos de alto rendimiento. Parte de ese objetivo se alcanzó a través del desarrollo de un portal específico usado para gestionar datos de geles 2D y delinear interacciones entre proteínas. La base de datos en línea se diseñó sobre la plataforma .NET y las búsquedas en dicha base de datos pueden realizarse de varias formas, como software de terceros y una serie de consultas habituales que están integradas en la base de datos.

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