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The european molecular biology linked original resources (TEMBLOR)

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Une base de données mondiale pour un consortium moléculaire

L'avènement de la recherche pluridisciplinaire en interaction moléculaire s'est traduit par la nécessité d'une base de connaissance unique, complète et facile d'accès. Le projet TEMBLOR a eu pour objectif d'intégrer les bases de données moléculaire, génomique et protéomique.

Économie numérique

Un consortium de grands fournisseurs publics de données d'interaction s'est ainsi réuni, pour créer une source unique de données dans le domaine de l'interaction moléculaire. Par ailleurs, au vu des avantages retirés par des projets similaires, dédiés aux protéines et au séquençage de l'ADN, le consortium IMEx a décidé de fournir un service similaire. Il se compose de membres spécialisés dans divers domaines comme l'interaction moléculaire, le développement de logiciel et l'instrumentation. Son but était de mettre en place une base de données pour assurer une capacité universelle de conservation. Le consortium propose en outre diverses catégories de partenariat, qui correspondent au niveau d'engagement d'un membre. Par exemple, un membre «archival» s'engage à fournir un certain nombre de documents, à importer les données conformément aux normes IMEx, et à les rendre accessibles mondialement. Le projet TEMBLOR devait aboutir à la construction d'une base de données qui contribuerait directement et compléterait les actions de divers groupes européens. Cette base de données propose diverses méthodes de recherche, notamment dans le texte, par structure et par séquence, sur une présentation génocentrique de tous les génomes. De plus, la documentation soumise peut aussi être utilisée sur un mode «de partage du travail», permettant à divers collaborateurs de travailler simultanément sur le même texte. Pour encourager l'usage des documents soumis, le consortium IMEx propose une licence appelée «Creative Commons Attribution License». Elle permet une utilisation publique de tous les rapports archivés dans les bases de données des partenaires (BIND, DIP, MPACT(MIPS), MINT et IntAct), pour autant que l'agrément soit cité. Le consortium compte actuellement plusieurs membres, et encourage fortement l'adhésion de plus de partenaires.

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