«Viva la diferencia» en el desfile de la identidad de las proteínas
La enfermedad monogénica de la fibrosis quística se caracteriza normalmente por la disfunción de la proteína clave reguladora de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística («cystic fibrosis transmembrane conductance regulator» o CFTR). La gravedad de la enfermedad en los distintos individuos varía, en gran medida, debido a la función de la proteína en muchas rutas distintas. Como consecuencia de ello, la expresión de la enfermedad varía en función de otros factores ambientales y genotípicos. La complejidad de las interacciones proteína-proteína que presenta la FQ resulta ideal para ser analizada mediante estudios de proteómica. Un conocimiento profundo de la estructura y función de las proteínas implicadas en las cascadas moleculares podría dirigir las vías de la investigación hacia un tratamiento a medida para cada paciente. En la empresa con sede en Alemania ProteoSys AG son expertos en investigación basada en la proteómica. En su calidad de socios del proyecto EUROPROCF, uno de sus principales objetivos era adaptar el análisis de las proteínas procedentes de las células de los pacientes con fibrosis quística que comparten una misma mutación pero presentan diferentes fenotipos, utilizando una versión adaptada del análisis de alto rendimiento con gel de dos dimensiones (2D). El método resultante, ProteoTopeTM, incorpora el etiquetado de dos o más muestras de proteínas con isótopos de yodo radiactivo. El despliegue diferencial de las proteínas se consigue incluyendo en el análisis proteómico sus variantes alternativas de corte y empalme (splicing) y sus isoformas postranscripcionales resultantes. Las proteínas etiquetadas diferencialmente se mezclan y se separan, estando juntas en la muestra, mediante electroforesis bidimensional con gel de poliacrilamida (PAGE 2D). Fundamentalmente, esto se puede lograr porque se puede determinar la relación de la intensidad de la señal radiactiva individual procedente de cada radioisótopo. Los patrones diferenciales de proteínas presentes en enfermedades como la FQ tienen repercusiones en el proceso de descubrimiento de medicamentos. Además, el protocolo ProteoTopeTM se puede aplicar a otras áreas de interés proteómico, incluida la investigación sobre el cáncer.
