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European network on functional genomics of type 2 diabetes

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De meilleures méthodes de détection du mauvais repliement protéique

Le fonctionnement biologique d'une protéine est déterminé par sa conformation tridimensionnelle et le repliement de sa structure. Des chercheurs venus de toute l'Europe se sont réunis pour développer de nouvelles méthodes d'analyse de ces conformations en situation pathologique.

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Le repliement aberrant d'une protéine provoque la perte de sa fonction biologique et induit la formation d'agrégats protéiques dans ou hors de la cellule. Ces évènements affectent grandement la santé et conduisent à l'apparition de diverses maladies systémiques de nature neurologique ou autre. Le projet UPMAN («Understanding protein misfolding and aggregation by NMR») financé par l'UE a été mis en place pour concevoir de nouvelles méthodes d'analyse permettant de mieux comprendre ces phénomènes de mauvais repliement protéique et d'agrégation. Les chercheurs du projet ont axé leurs travaux sur des stratégies de spectroscopie utilisant la résonance magnétique nucléaire (RMN) associées à des logiciels appropriés pour étudier la capacité de repliement des diverses espèces protéiques. Grâce à ces nouvelles techniques NMR, les chercheurs ont pu analyser des fragments protéiques hautement flexibles incapables de se replier et des protéines précurseurs d'amas fibrillaires – la forme la plus toxique des maladies du repliement protéique. Ces chaînes polypeptidiques forment des structures qui diffèrent sensiblement de celles des protéines natives et pourraient être analysées par des méthodes conventionnelles. En générant une information structurelle sur le statut de ces protéines pré-fibrillaires, les chercheurs du projet UPMAN espèrent stimuler le développement de composés pharmaceutiques susceptibles d'agir contre certaines de ces maladies débilitantes. Les mécanismes fondamentaux du mauvais repliement et de l'agrégation protéique restent cependant à élucider.

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