Transfert de gène hautement spécifique
La modification directe d'un gène ciblé comme emplacement génomique, sans l'introduction de séquences redondantes supplémentaires, constitue une stratégie intéressante pour la thérapie génétique. Le remplacement génétique ciblé est possible grâce à des ligands de liaison d'ADN spécifiques de séquence tels que les oligonucléotides à brin unique (ssODN - single-stranded oligonucleotides), les oligonucléotides à triple hélice (TFO - triple-helix–forming oligonucleotides) et les acides nucléiques peptidiques (ANP). Les partenaires avaient développé une méthode dans laquelle ils utilisaient des oligomères composés de deux domaines fonctionnels. Le domaine ciblé offre une affinité de séquence très forte pour le locus désiré dans le génome et le domaine modèle active les mécanismes de réparation cellulaire pour induire de petites modifications de séquences sans laisser de séquences totalement modifiées. L'objectif du projet Sniper («Sequence specific oligomers for in vivo DNA repair») financé par l'UE était d'améliorer la conception de la technologie de plateforme d'oligomères pour pouvoir induire des changements précis à base individuelle dans une culture de cellules plus rapidement. Pour ce faire, les partenaires du projet ont étudié les paramètres biologiques impliqués dans les changements génomiques induits par les ssODN. Ils ont également modifié les bases des TFO pour renforcer la stabilité du triplexe et la cinétique de liaison. Les molécules supplémentaires explorées par le consortium pour la reconnaissance de l'ADN et responsable de la recombinaison comprenaient les ANP et les nucléases à doigts de zinc. Ces dernières sont des enzymes de restriction artificielles créées par la fusion d'un domaine de liaison à l'ADN, de type «doigt de zinc», et d'un domaine catalytique de coupure de l'ADN conçu pour cibler les séquences d'ADN pertinentes. Dans l'ensemble, tous les ligands de liaison à l'ADN testé au cours du projet Sniper ont démontré le potentiel d'altération de séquences d'ADN ciblées et donc de réparation génétique. Les applications de ces oligomères sont vastes et à l'exception des besoins de recherche, il est prévu qu'ils soient utilisés comme alternatives de transfert génétique.
