Des outils efficaces pour l'élevage en amélioration génétique des cultures
Depuis des années, les phytogénéticiens ont cherché à améliorer le développement et le rendement des plantes cultivées dans différentes conditions environnementales. Malgré les progrès en techniques de génotypage (caractérisation génétique) et de phénotypage (caractérisation des traits observables), les sociétés spécialisées dans l'amélioration des plantes tentent toujours de découvrir des méthodes de phénotypage efficaces et des méthodologies permettant d'associer les traits phénotypiques aux informations génétiques. Un projet financé par l'UE intitulé SPICY («Smart tools for prediction and improvement of crop yield») visait à contribuer à un ensemble d'outils pour répondre à ce problème. Le projet a utilisé le poivre comme plante modèle et le rendement comme un exemple d'un trait complexe. Les partenaires du projet sont issus d'institutions de recherche et de l'industrie spécialisée dans l'amélioration des plantes. Un objectif du projet était de fournir un ensemble de marqueurs moléculaires à utiliser pour la prévision de phénotypes dans le modèle gène-à-phénotype. Les chercheurs ont pu produire une bibliothèque pratiquement complète de gènes exprimés ainsi qu'une liste de gènes candidats pour les traits de plantes et de fruits pour le poivre et les autres plantes. Un fluorimètre et un instrument d'analyse d'image ont également été très utiles pour le phénotypage végétal. Les chercheurs ont intégré ce dernier dans un type de robot d'imagerie. Il utilise des caméras de proche infrarouge et des paramètres de couleurs pour capturer des images de plantes en pleine croissance dans les serres, sans les perturber. L'équipe a pu développer un modèle de croissance de plantes cultivées capable de prédire le rendement pour de nombreux génotypes en comptabilisant les différences environnementales. Elle a utilisé des marqueurs génétiques pour estimer les paramètres de modèles spécifiques au génotype. Les outils développés au cours du projet amélioreront l'efficacité de la sélection de génotypes relatifs aux traits complexes de développement. Le principal objectif est de renforcer l'amélioration génétique des plantes pour soutenir l'agriculture durable.
