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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Autonomous Computing Artificial Cells

Descripción del proyecto

El ADN y las cápsulas semipermeables forman células artificiales para aplicaciones de computación molecular

A lo largo de los dos últimos decenios, se ha explorado cada vez más en numerosas publicaciones el potencial de las redes de reacción química basadas en ADN (DNA-CRN, por sus siglas en inglés) para actuar como componentes básicos de circuitos basados en ADN y arquitecturas de computación molecular. Sin embargo, la lentitud en el progreso en la construcción de dispositivos reales ha resultado frustrante. El proyecto AMIGA, financiado con fondos europeos, pretende ser el primero en definir un nuevo paradigma de los sistemas de información molecular basado en la integración de ADN-CRN en microcápsulas semipermeables. Las células artificiales de computación autónoma resultantes tendrán el potencial de almacenar memoria de forma permanente. Los nuevos circuitos moleculares podrían tener aplicaciones interesantes en áreas que van desde la biomedicina hasta la informática digital.

Objetivo

We propose an ambitious 5-year multidisciplinary program that seeks to pioneer and establish a fundamentally new paradigm in molecular information systems that is based on novel conceptual and experimental advances on the integration of DNA-based chemical reaction networks (CRNs) and semipermeable microcapsules, i.e. protocells. In AutonoMous computInG Artificial cells (AMIGA), we will establish a platform technology, based on molecular communication between interacting protocells, capable of revolutionary new modes of molecular sensing, computation and data storage/retrieval.
Progress in this emerging field requires i) the development of computer-aided design (CAD) strategies to implement large-scale CRNs consisting of hundreds of components, ii) formulating suitable micro-substrates, such as droplets or vesicles, to spatially localize CRNs and ways to manipulate their interconnection and iii) strategies that allow direct recording of molecular operations onto a chemical storage medium such as DNA. We address these challenges via a comprehensive research program in which we implement large-scale, DNA-based CRNs by localization of components in interacting protocells resulting in distributed molecular circuits programmed to display advanced computational functions such as (i) asynchronous logic, (ii) integral feedback control and (iii) molecular pattern recognition. Combining protocell localization with recent advances in CRISPR base editors, we will construct an integrated system where molecular operations can write instructions on permanent memory storage elements. The developed methodology finds applications in emerging technologies aimed at using molecular circuits for in-vitro diagnostics and the use of synthetic DNA as a storage medium for digital data.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

ERC-COG - Consolidator Grant

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2020-COG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

TECHNISCHE UNIVERSITEIT EINDHOVEN
Aportación neta de la UEn
€ 1 999 497,00
Dirección
GROENE LOPER 3
5612 AE Eindhoven
Países Bajos
Región
Zuid-Nederland Noord-Brabant Zuidoost-Noord-Brabant
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 1 999 497,00

Beneficiarios (1)