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Autonomous Computing Artificial Cells

Projektbeschreibung

Die Bildung künstlicher Zellen aus DNA und semipermeablen Kapseln für molekulare Informatikanwendungen

In den letzten zwei Jahrzehnten wurde das Potenzial chemischer Reaktionsnetzwerke auf Grundlage von DNA, als Bausteine DNA-basierter Schaltkreise und molekularer Computerarchitekturen zu fungieren, in zahlreichen Veröffentlichungen umfassender untersucht. Allerdings verläuft der Fortschritt bei der Konstruktion tatsächlicher Geräte sehr schleppend. Das EU-finanzierte Projekt AMIGA hat vor, ein neues Paradigma für molekulare Informationssysteme einzuführen, das auf der Einbindung chemischer Reaktionsnetzwerke auf Grundlage von DNA in semipermeable Kapseln beruht. Die daraus resultierenden künstlichen autonomen Computerzellen werden enormes Potenzial zur permanenten Datenspeicherung haben. Neuartige molekulare Schaltkreise könnten mit spannenden Anwendungen in Bereichen von der Biomedizin bis hin zur digitalen Informatik einhergehen.

Ziel

We propose an ambitious 5-year multidisciplinary program that seeks to pioneer and establish a fundamentally new paradigm in molecular information systems that is based on novel conceptual and experimental advances on the integration of DNA-based chemical reaction networks (CRNs) and semipermeable microcapsules, i.e. protocells. In AutonoMous computInG Artificial cells (AMIGA), we will establish a platform technology, based on molecular communication between interacting protocells, capable of revolutionary new modes of molecular sensing, computation and data storage/retrieval.
Progress in this emerging field requires i) the development of computer-aided design (CAD) strategies to implement large-scale CRNs consisting of hundreds of components, ii) formulating suitable micro-substrates, such as droplets or vesicles, to spatially localize CRNs and ways to manipulate their interconnection and iii) strategies that allow direct recording of molecular operations onto a chemical storage medium such as DNA. We address these challenges via a comprehensive research program in which we implement large-scale, DNA-based CRNs by localization of components in interacting protocells resulting in distributed molecular circuits programmed to display advanced computational functions such as (i) asynchronous logic, (ii) integral feedback control and (iii) molecular pattern recognition. Combining protocell localization with recent advances in CRISPR base editors, we will construct an integrated system where molecular operations can write instructions on permanent memory storage elements. The developed methodology finds applications in emerging technologies aimed at using molecular circuits for in-vitro diagnostics and the use of synthetic DNA as a storage medium for digital data.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

ERC-COG - Consolidator Grant

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-COG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

TECHNISCHE UNIVERSITEIT EINDHOVEN
Netto-EU-Beitrag
€ 1 999 497,00
Adresse
GROENE LOPER 3
5612 AE Eindhoven
Niederlande
Region
Zuid-Nederland Noord-Brabant Zuidoost-Noord-Brabant
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
€ 1 999 497,00

Begünstigte (1)