Autonomous Computing Artificial Cells

Informations projet

AMIGA

N° de convention de subvention: 101000199

DOI

10.3030/101000199

Date de signature de la CE 17 Decembre 2020

Date de début 1 Février 2022

Date de fin 31 Juillet 2027

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 497,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 497,00

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITEIT EINDHOVEN
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (11)

A microfluidic optimal experimental design platform for forward design of cell-free genetic networks

Auteurs: Bob van Sluijs, Roel J. M. Maas, Ardjan J. van der Linden, Tom F. A. de Greef, Wilhelm T. S. Huck
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-31306-3

Engineering a Scalable and Orthogonal Platform for Synthetic Communication in Mammalian Cells

Auteurs: Anna-Maria Makri Pistikou; Glenn A.O. Cremers; Bryan L. Nathalia; Bas W.A. Bögels; Bruno V. Eijkens; Anne de Dreu; Maarten T.H. Bezembinder; Oscar M.J.A. Stassen; Carlijn C.V. Bouten; Maarten Merkx; Roman Jerala; Tom F. A. de Greef
Publié dans: Nature Communications, Numéro 1, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.01.18.524631

Noise Minimization in Cell-Free Gene Expression

Auteurs: Mart W. Bartelds, Óscar García-Blay, Pieter G. A. Verhagen, Elise J. Wubbolts, Bob van Sluijs, Hans A. Heus, Tom F. A. de Greef, Wilhelm T. S. Huck, and Maike M. K. Hansen
Publié dans: ACS Synthetic Biology, 2023, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00174

Orthogonal Light-Dependent Membrane Adhesion Induces Social Self-Sorting and Member-Specific DNA Communication in Synthetic Cell Communities

Auteurs: Ali Heidari, Oya I Sentürk, Shuo Yang, Alex Joesaar, Pierangelo Gobbo, Stephen Mann, Tom FA de Greef, Seraphine V Wegner
Publié dans: Small, 2023, ISSN 1613-6810
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202206474

Mechanism-based and data-driven modeling in cell-free synthetic biology

Auteurs: Angelina Yurchenko, Gökçe Özkul, Natal A. W. van Riel, Jan C. M. van Hest, Tom F. A. de Greef
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 60, 2024, Page(s) 6466-6475, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cc01289e

Protocellular CRISPR/Cas‐Based Diffusive Communication Using Transcriptional RNA Signaling

Auteurs: Shuo Yang; Alex Joesaar; Bas W. A. Bögels; Stephen Mann; Tom F. A. de Greef
Publié dans: Angewandte Chemie. International Edition, 61, 1 - 9, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-9, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202202436

DNA Input Classification by a Riboregulator-Based Cell-Free Perceptron

Auteurs: Ardjan J. van der Linden, Pascal A. Pieters, Mart W. Bartelds, Bryan L. Nathalia, Peng Yin, Wilhelm T. S. Huck, Jongmin Kim, Tom F. A. de Greef
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 11, 2023, Page(s) 1510-1520, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.1c00596

Bilayer Microfluidic Device for Combinatorial Plug Production

Auteurs: Maaruthy Yelleswarapu, Sofia Spinthaki, Tom F. A. de Greef, Federica Eduati
Publié dans: Journal of Visualized Experiments, 2024, ISSN 1940-087X
Éditeur: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/66154

DNA Reaction System That Acquires Classical Conditioning

Auteurs: Takashi Nakakuki, Masato Toyonari, Kaori Aso, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma, Tom F. A. de Greef
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 13, 2024, Page(s) 521-529, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00459

A Synthetic Protocell‐Based Heparin Scavenger

Auteurs: Qing Liu, Shuo Yang, Iris Seitz, Anna‐Maria Makri Pistikou, Tom F. A. de Greef, Mauri A. Kostiainen
Publié dans: Small, Numéro 19, 2023, ISSN 1613-6810
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202201790

DNA storage in thermoresponsive microcapsules for repeated random multiplexed data access

Auteurs: Bas W. A. Bögels, Bichlien H. Nguyen, David Ward, Levena Gascoigne, David P. Schrijver, Anna-Maria Makri Pistikou, Alex Joesaar, Shuo Yang, Ilja K. Voets, Willem J. M. Mulder, Andrew Phillips, Stephen Mann, Georg Seelig, Karin Strauss, Yuan-Jyue Chen & Tom F. A. de Greef
Publié dans: Nature Nanotechnology, 2023, ISSN 1748-3387
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-023-01377-4