Autonomous Computing Artificial Cells

Projektinformationen

AMIGA

ID Finanzhilfevereinbarung: 101000199

DOI

10.3030/101000199

EK-Unterschriftsdatum 17 Dezember 2020

Startdatum 1 Februar 2022

Enddatum 31 Juli 2027

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 999 497,00

EU-Beitrag

€ 1 999 497,00

Koordiniert durch

TECHNISCHE UNIVERSITEIT EINDHOVEN
Netherlands

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (11)

A microfluidic optimal experimental design platform for forward design of cell-free genetic networks

Autoren: Bob van Sluijs, Roel J. M. Maas, Ardjan J. van der Linden, Tom F. A. de Greef, Wilhelm T. S. Huck
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-31306-3

Engineering a Scalable and Orthogonal Platform for Synthetic Communication in Mammalian Cells

Autoren: Anna-Maria Makri Pistikou; Glenn A.O. Cremers; Bryan L. Nathalia; Bas W.A. Bögels; Bruno V. Eijkens; Anne de Dreu; Maarten T.H. Bezembinder; Oscar M.J.A. Stassen; Carlijn C.V. Bouten; Maarten Merkx; Roman Jerala; Tom F. A. de Greef
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 1, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.01.18.524631

Noise Minimization in Cell-Free Gene Expression

Autoren: Mart W. Bartelds, Óscar García-Blay, Pieter G. A. Verhagen, Elise J. Wubbolts, Bob van Sluijs, Hans A. Heus, Tom F. A. de Greef, Wilhelm T. S. Huck, and Maike M. K. Hansen
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, 2023, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00174

Orthogonal Light-Dependent Membrane Adhesion Induces Social Self-Sorting and Member-Specific DNA Communication in Synthetic Cell Communities

Autoren: Ali Heidari, Oya I Sentürk, Shuo Yang, Alex Joesaar, Pierangelo Gobbo, Stephen Mann, Tom FA de Greef, Seraphine V Wegner
Veröffentlicht in: Small, 2023, ISSN 1613-6810
Herausgeber: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202206474

Mechanism-based and data-driven modeling in cell-free synthetic biology

Autoren: Angelina Yurchenko, Gökçe Özkul, Natal A. W. van Riel, Jan C. M. van Hest, Tom F. A. de Greef
Veröffentlicht in: Chemical Communications, Ausgabe 60, 2024, Seite(n) 6466-6475, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cc01289e

Protocellular CRISPR/Cas‐Based Diffusive Communication Using Transcriptional RNA Signaling

Autoren: Shuo Yang; Alex Joesaar; Bas W. A. Bögels; Stephen Mann; Tom F. A. de Greef
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie. International Edition, 61, 1 - 9, Ausgabe 1, 2022, Seite(n) 1-9, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202202436

DNA Input Classification by a Riboregulator-Based Cell-Free Perceptron

Autoren: Ardjan J. van der Linden, Pascal A. Pieters, Mart W. Bartelds, Bryan L. Nathalia, Peng Yin, Wilhelm T. S. Huck, Jongmin Kim, Tom F. A. de Greef
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 11, 2023, Seite(n) 1510-1520, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.1c00596

Bilayer Microfluidic Device for Combinatorial Plug Production

Autoren: Maaruthy Yelleswarapu, Sofia Spinthaki, Tom F. A. de Greef, Federica Eduati
Veröffentlicht in: Journal of Visualized Experiments, 2024, ISSN 1940-087X
Herausgeber: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/66154

DNA Reaction System That Acquires Classical Conditioning

Autoren: Takashi Nakakuki, Masato Toyonari, Kaori Aso, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma, Tom F. A. de Greef
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 13, 2024, Seite(n) 521-529, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00459

A Synthetic Protocell‐Based Heparin Scavenger

Autoren: Qing Liu, Shuo Yang, Iris Seitz, Anna‐Maria Makri Pistikou, Tom F. A. de Greef, Mauri A. Kostiainen
Veröffentlicht in: Small, Ausgabe 19, 2023, ISSN 1613-6810
Herausgeber: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202201790

DNA storage in thermoresponsive microcapsules for repeated random multiplexed data access

Autoren: Bas W. A. Bögels, Bichlien H. Nguyen, David Ward, Levena Gascoigne, David P. Schrijver, Anna-Maria Makri Pistikou, Alex Joesaar, Shuo Yang, Ilja K. Voets, Willem J. M. Mulder, Andrew Phillips, Stephen Mann, Georg Seelig, Karin Strauss, Yuan-Jyue Chen & Tom F. A. de Greef
Veröffentlicht in: Nature Nanotechnology, 2023, ISSN 1748-3387
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-023-01377-4