Descripción del proyecto
El papel de la matriz de la biopelícula en las comunidades microbianas
Las bacterias viven en comunidades microbianas complejas organizadas en su mayoría en biopelículas. Nuevas pruebas sugieren que las interacciones intrínsecas entre bacterias están determinadas por la composición de la matriz de la biopelícula. El objetivo del proyecto BioMatrix, financiado con fondos europeos, es estudiar los mecanismos relacionados con las biopelículas que definen las comunidades microbianas. Sus investigadores se proponen modificar y rastrear la expresión de componentes de la matriz de la biopelícula y evaluar su papel funcional en diferentes condiciones ecológicas. Los resultados del proyecto BioMatrix aportarán conocimientos fundamentales sobre la actividad y la resiliencia de las comunidades microbianas, con aplicaciones directas en biotecnología. Es más, se espera que fomenten que la investigación abandone los estudios «in vitro» reduccionistas basados en un único organismo modelo.
Objetivo
Complex microbial communities are comprised of diverse, interacting species. Often, such interactions result in outcomes that cannot be predicted from studies of their individual components in isolation. However, the underlying mechanisms resulting in such community intrinsic properties remain unidentified. The overarching aim of BioMatrix is to identify the molecular mechanisms underpinning community intrinsic properties of bacterial communities.
In nature, bacterial communities are predominantly organized as biofilms in which the cells are encased in a self-produced polymeric matrix. I hypothesize that the altered matrix composition of multispecies biofilms is the primary cause of community intrinsic properties defining bacterial communities. BioMatrix will test this hypothesis using expression studies of genes encoding matrix components and functional assessments of gene deletions leading to loss of specific matrix components. These will be addressed in settings of increasing environmental and community complexity, thus ensuring ecological relevance. High-resolution methodologies for single-cell detection will be combined with advanced image analysis to enable crucial micro-scale studies of bacterial communities. New approaches, such as printing 3D leaves suitable for manipulation and microscopy analysis, will be developed and applied to expand exploration to in situ conditions.
BioMatrix will close a primary knowledge gap in microbial ecology, by identifying fundamental mechanisms shaping bacterial communities. The impact of these mechanisms for community function and protection will be validated in settings of high community and environmental complexity. This will theoretically and experimentally advance biofilm research, addressing a severe bias towards in vitro studies of model organisms. The fundamental findings of BioMatrix will be directly applicable in a variety of biotechnological industries depending on community activity, interaction and resilience.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-COG - Consolidator GrantInstitución de acogida
1165 Kobenhavn
Dinamarca