Description du projet
Rôle des «points chauds nucléaires» dans le nouveau paradigme de l’expression génique
Selon un nouveau paradigme de l’expression génétique, les gènes et les facteurs de transcription coopèrent pour former des points chauds nucléaires spécialisés, optimisés pour la transcription. Le projet Hotspot, financé par l’UE, étudiera les points chauds qui précèdent la transcription pendant l’embryogenèse du poisson zèbre. Ces points chauds particuliers sont de grande taille, isolés, de longue durée de vie et leur formation peut être modifiée de manière spécifique. Dans un premier temps, la recherche déterminera les déclencheurs de la formation des points chauds, les composants des points chauds et l’ordre de leur formation, puis l’étude des gènes qui se regroupent. Les chercheurs développeront une méthode innovante pour visualiser les gènes à copie unique afin de révéler comment des programmes d’expression génétique stables peuvent émerger des interactions auto-organisées entre la chromatine, les facteurs de transcription et les propriétés des sites de transcription.
Objectif
There is accumulating evidence for a new gene expression paradigm, in which genes and transcription factors cooperate to create specialized nuclear hotspots optimized for transcription. How hotspots form, and how they impact transcription, however, is unclear. This is mostly because mechanistic and functional approaches have been limited by the large number of hotspots per nucleus, their small size, and their transient nature. Here, wThere is accumulating evidence for a new gene expression paradigm, in which genes and transcription factors cooperate to create specialized nuclear hotspots optimized for transcription. How hotspots form, and how they impact transcription, however, is unclear. This is mostly because mechanistic and functional approaches have been limited by the large number of hotspots per nucleus, their small size, and their transient nature. Here, we will take advantage of two hotspots that precede all other transcription during zebrafish embryogenesis. The hotspots are large, isolated, and relatively long-lived, and we can interfere with their formation specifically. They therefore provide an excellent opportunity to study nuclear hotspots. The stereotyped activation of transcription during embryogenesis further provides the opportunity to determine the effect of hotspots on gene expression. In Aim 1, we will determine what triggers hotspot formation, identify the components of hotspots and the order in which they come together, and determine the enrichment of components in hotspots compared to nucleoplasm. In Aim 2, we turn our attention to the genes that come together in these hotspots. We will develop a method to visualize single copy genes live and use this to determine how genes come together in transcription hotspots to be activated. Together, the work we propose will reveal how stable gene expression programs can emerge from the self- organizing interactions between chromatin, transcription factors and emergent properties of transcribed sites.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1015 LAUSANNE
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.