Description du projet
Une technologie de puce innovante pour améliorer la spectrométrie de masse appliquée aux systèmes protéiques
De nombreuses protéines importantes ne peuvent pas être étudiées par le biais des méthodes traditionnelles d’analyse structurelle car elles sont instables, trop grosses ou présentes en quantités limitées dans leur état d’origine. Une approche prometteuse consiste à utiliser la spectrométrie de masse pour mesurer l’échange hydrogène/deutérium dans les protéines (HDX-MS). Le projet HDXchip, financé par l’UE, a pour objectif de développer des micropuces innovantes pour révolutionner la méthode HDX-MS afin de permettre l’analyse de systèmes protéiques d’une très grande complexité. Cette technologie permettra d’améliorer les applications HDX-MS, notamment l’analyse des conformations et des interactions de grands complexes protéiques et l’analyse des protéines à l’intérieur de leurs membranes lipidiques. La réussite du projet pourrait nous offrir une bien meilleure compréhension de la fonction de ces protéines et de leur potentiel en matière de ciblage par des médicaments.
Objectif
Many proteins important in biology or disease are not amenable to traditional methods for structural analysis as they cannot be isolated in sufficient amounts nor studied directly in their native environment. Alternative techniques are needed to understand the conformation and interactions of such difficult proteins and further support the on-going shift to protein-based ‘biopharmaceuticals’ in the pharmaceutical industry. One promising technique to meet this challenge is the use of mass spectrometry to measure the hydrogen/deuterium exchange of proteins (HDX-MS). However, HDX-MS suffers from significant limitations to realize its full potential and applicability.
HDXchip aims to develop innovative microchips to revolutionize the HDX-MS method and enable analysis of difficult protein systems of unprecedented complexity. HDXchip will create “HDX-MS 2.0” technology that integrates on-chip sample treatment and separation to overcome major limitations of the conventional method, including virtually eliminating unwanted deuterium loss (back-exchange). The key to fabrication of HDXchips lie in the fact that all elements will be made of thiol-ene polymers. These polymers are not only used to make the chip itself in a cheap and simple manner, but also to fabricate high surface area functionalities for fast sample treatment (incl. enzymatic reactions) and separation at unprecedented efficiency.
HDXchip will enable step-change improvements in popular HDX-MS applications, like analysis of the conformation and interactions of purified proteins and also open up for exciting and hitherto unfeasible applications such as analysis of proteins inside whole cells and proteins in their native lipid membranes. Hence, HDXchip could enable breakthrough insights into the conformation of difficult protein systems both in isolation and in their native environment, and dramatically improve our understanding of the function of such proteins and their potential to be targeted by drugs.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.