Descrizione del progetto
Una tecnologia innovativa per chip per migliorare la spettrometria di massa di sistemi proteici
Numerose proteine importanti non sono esaminabili tramite metodi tradizionali di analisi strutturale poiché sono instabili, troppo grandi oppure presenti in quantità ridotte allo stato nativo. Un approccio promettente consiste nell’impiegare la spettrometria di massa per misurare lo scambio idrogeno/deuterio di proteine (Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry, HDX-MS). Il progetto HDXchip, finanziato dall’UE, si propone di sviluppare microchip innovativi per rivoluzionare tale metodo al fine di consentire l’analisi di sistemi proteici altamente complessi. Questa tecnologia migliorerà le applicazioni di HDX-MS, quali l’analisi delle conformazioni e delle interazioni di grandi complessi di proteine e l’analisi di proteine all’interno delle rispettive membrane lipidiche. La riuscita del progetto può rafforzare nettamente la comprensione delle funzioni di tali proteine e la loro possibilità di essere individuate da farmaci.
Obiettivo
Many proteins important in biology or disease are not amenable to traditional methods for structural analysis as they cannot be isolated in sufficient amounts nor studied directly in their native environment. Alternative techniques are needed to understand the conformation and interactions of such difficult proteins and further support the on-going shift to protein-based ‘biopharmaceuticals’ in the pharmaceutical industry. One promising technique to meet this challenge is the use of mass spectrometry to measure the hydrogen/deuterium exchange of proteins (HDX-MS). However, HDX-MS suffers from significant limitations to realize its full potential and applicability.
HDXchip aims to develop innovative microchips to revolutionize the HDX-MS method and enable analysis of difficult protein systems of unprecedented complexity. HDXchip will create “HDX-MS 2.0” technology that integrates on-chip sample treatment and separation to overcome major limitations of the conventional method, including virtually eliminating unwanted deuterium loss (back-exchange). The key to fabrication of HDXchips lie in the fact that all elements will be made of thiol-ene polymers. These polymers are not only used to make the chip itself in a cheap and simple manner, but also to fabricate high surface area functionalities for fast sample treatment (incl. enzymatic reactions) and separation at unprecedented efficiency.
HDXchip will enable step-change improvements in popular HDX-MS applications, like analysis of the conformation and interactions of purified proteins and also open up for exciting and hitherto unfeasible applications such as analysis of proteins inside whole cells and proteins in their native lipid membranes. Hence, HDXchip could enable breakthrough insights into the conformation of difficult protein systems both in isolation and in their native environment, and dramatically improve our understanding of the function of such proteins and their potential to be targeted by drugs.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze chimiche scienze dei polimeri
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1165 KOBENHAVN
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.