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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Analysis of “difficult” proteins by microfluidic-based hydrogen/deuterium exchange

Projektbeschreibung

Innovative Chip-Technologie soll Massenspektrometrie von Proteinsystemen verbessern

Da viele wichtige Proteine instabil oder zu groß sind oder in ihrem ursprünglichen Zustand nur in begrenzten Mengen vorkommen, können sie nicht mit traditionellen Methoden der Strukturanalyse erforscht werden. Ein vielversprechender Ansatz ist eine Untersuchung des Wasserstoff-Deuterium-Austauschs in Proteinen per Massenspektrometrie (HDX-MS). Das EU-finanzierte Projekt HDXchip will innovative Mikrochips entwickeln, um die HDX-MS-Methode so zu revolutionieren, dass zukünftig Proteinsysteme mit äußerst hoher Komplexität analysiert werden können. Dank dieser Technologie werden sich einzelne Anwendungen von HDX-MS optimieren lassen, wie beispielsweise die Analyse von Konformationen und Interaktionen großer Proteinkomplexe oder die Analyse von Proteinen innerhalb ihrer Lipidmembranen. Ist das Projekt erfolgreich, könnte sich der Wissensstand über die Funktion solcher Proteine und ihre potenzielle gezielte Ansprechbarkeit über Wirkstoffe deutlich verbessern.

Ziel

Many proteins important in biology or disease are not amenable to traditional methods for structural analysis as they cannot be isolated in sufficient amounts nor studied directly in their native environment. Alternative techniques are needed to understand the conformation and interactions of such difficult proteins and further support the on-going shift to protein-based ‘biopharmaceuticals’ in the pharmaceutical industry. One promising technique to meet this challenge is the use of mass spectrometry to measure the hydrogen/deuterium exchange of proteins (HDX-MS). However, HDX-MS suffers from significant limitations to realize its full potential and applicability.
HDXchip aims to develop innovative microchips to revolutionize the HDX-MS method and enable analysis of difficult protein systems of unprecedented complexity. HDXchip will create “HDX-MS 2.0” technology that integrates on-chip sample treatment and separation to overcome major limitations of the conventional method, including virtually eliminating unwanted deuterium loss (back-exchange). The key to fabrication of HDXchips lie in the fact that all elements will be made of thiol-ene polymers. These polymers are not only used to make the chip itself in a cheap and simple manner, but also to fabricate high surface area functionalities for fast sample treatment (incl. enzymatic reactions) and separation at unprecedented efficiency.
HDXchip will enable step-change improvements in popular HDX-MS applications, like analysis of the conformation and interactions of purified proteins and also open up for exciting and hitherto unfeasible applications such as analysis of proteins inside whole cells and proteins in their native lipid membranes. Hence, HDXchip could enable breakthrough insights into the conformation of difficult protein systems both in isolation and in their native environment, and dramatically improve our understanding of the function of such proteins and their potential to be targeted by drugs.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

ERC-COG - Consolidator Grant

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-COG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 1 999 752,00
Adresse
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Dänemark

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Region
Danmark Hovedstaden Byen København
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 1 999 752,00

Begünstigte (1)

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