Fast Infrared Coherent Harmonic Microscopy

Información del proyecto

FAIR CHARM

Identificador del acuerdo de subvención: 101016457

DOI

10.3030/101016457

Fecha de la firma de la CE 15 Diciembre 2021

Fecha de inicio 1 Enero 2022

Fecha de finalización 30 Junio 2026

Financiado con arreglo a

• INDUSTRIAL LEADERSHIP - Leadership in enabling and industrial technologies - Information and Communication Technologies (ICT)

Coste total

€ 5 944 726,25

Aportación de la UE

€ 5 944 726,25

Coordinado por

UNIVERSITE DE GENEVE
Switzerland

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Demonstrators, pilots, prototypes (4)

Functional upgraded SLIDE

D4.2 (MONTH 32) FUNCTIONAL UPGRADED SLIDE prototype with improvements based on feedback from first biomedical applications

Research-grade SLIDE @ UzL

D24 MONTH 18 Researchgrade SLIDE system functional at UZL with high framerate and fast volumetric imaging

SWIM 2 @ UniGE

D23 MONTH 18 Second SWIM prototype installed at UniGE for photophysics assessment LAV

SLIDE laboratory prototype (v1.0)

D31 MONTH 18 SLIDE laboratory prototype v10 ready to ship to UniGE month 18 and KUL month 21

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

D81 Completion of the Data Management Plan in agreement with the FAIR Findable Accessible Interoperable and Reusable principles

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

FAIR CHARM website

D71 MONTH 3 FAIR CHARM website online

Other (1)

3D annotation software ready

D25 MONTH 18 3D annotation software and domain specific 3D image processing tools ready

Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

Nucleus segmentation: towards automated solutions

Autores: R. Hollandi, N. Moshkov, L. Paavolainen, E. Tasnadi, F. Piccinini, P. Horvath
Publicado en: Trends in Cell Biology, Edición 32, 2022, Página(s) 295-310, ISSN 1879-3088
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.tcb.2021.12.004

Nutrients activate distinct patterns of small-intestinal enteric neurons

Autores: Candice Fung, Tom Venneman, Amy M. Holland, Tobie Martens, Milvia I. Alata, Marlene M. Hao, Ceyhun Alar, Yuuki Obata, Jan Tack, Alejandro Sifrim, Vassilis Pachnis, Werend Boesmans, Pieter Vanden Berghe
Publicado en: Nature, Edición 644, 2025, Página(s) 1069-1077, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09228-z

The Effect of a Lipid Surface Coating on the Permeation of Upconverting Nanoparticles through a 3D Human Lung Epithelial Model

Autores: Doyoung Kim, Gabrielle A. Mandl, Marta Balkota, Jimmy Vernaz, Song Huang, Samuel Constant, Pierre Maechler, Christine DeWolf, John A. Capobianco, Luigi Bonacina
Publicado en: Advanced Functional Material, 2024, Página(s) 2310078, ISSN 1616-301X
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202310078

Multi-Harmonic Imaging-Based Automated Recognition of Cutaneous T-Cell Lymphoma

Autores: Shayantani Ghosh, Olesya Pavlova, Alexandra Latshaw, Doyoung Kim, Christoph Iselin, Pauline Bernard, Pacome Prompsy, Yun-Tsan Chang, Davide Staedler, Yi-Chien Tsai, Luigi Bonacina, Emmanuella Guenova
Publicado en: British Journal of Dermatology, 2025, ISSN 0007-0963
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1093/bjd/ljaf345

Effect of tissue fixation on the optical properties of structural components assessed by non-linear microscopy imaging

Autores: M. Andrea Markus, Daniele P. Ferrari, Frauke Alves, Fernanda Ramos-Gomes
Publicado en: Biomedical Optics Express, Edición 14(8), 2023, Página(s) 3988-4002, ISSN 2156-7085
Editor: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.488453

Cell segmentation and representation with shape priors

Autores: D. Hirling, P. Horvath
Publicado en: Computational and Structural Biotechnology Journal, Edición 21, 2022, Página(s) 742-750, ISSN 2001-0370
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.12.034

Harmonic Imaging of Stem Cells in Whole Blood at GHz Pixel Rate

Autores: Sebastian Karpf, Nina Glöckner Burmeister, Laurence Dubreil, Shayantani Ghosh, Reka Hollandi, Julien Pichon, Isabelle Leroux, Alessandra Henkel, Valerie Lutz, Jonas Jurkevičius, Alexandra Latshaw, Vasyl Kilin, Tonio Kutscher, Moritz Wiggert, Oscar Saavedra-Villanueva, Alfred Vogel, Robert A. Huber, Peter Horvath, Karl Rouger, Luigi Bonacina
Publicado en: Small, 2024, ISSN 1613-6810
Editor: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202401472

Broadband frequency-doubling of a swept-source laser from 1550 nm to 775 nm using a fan-out crystal and application in 2kHz LiDAR ranging

Autores: Tonio F. Kutscher, Christian Stock, Florian Sommer, Jonas Jurkevicius, Stefan Meyer, Moritz Wiggert, Philipp Lamminger, Sebastian Karpf
Publicado en: Optics Express, Edición 33, 2025, Página(s) 10637, ISSN 1094-4087
Editor: Optical Society of America
DOI: 10.1364/oe.541976

Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity

Autores: Andreas Mund, Fabian Coscia, András Kriston, Réka Hollandi, Ferenc Kovács, Andreas-David Brunner, Ede Migh, Lisa Schweizer, Alberto Santos, Michael Bzorek, Soraya Naimy, Lise Mette Rahbek-Gjerdrum, Beatrice Dyring-Andersen, Jutta Bulkescher, Claudia Lukas, Mark Adam Eckert, Ernst Lengyel, Christian Gnann, Emma Lundberg, Peter Horvath, Matthias Mann
Publicado en: Nature Biotechnology, Edición 40, 2022, Página(s) 1231–1240, ISSN 1087-0156
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-022-01302-5