Fast Infrared Coherent Harmonic Microscopy

Informations projet

FAIR CHARM

N° de convention de subvention: 101016457

DOI

10.3030/101016457

Date de signature de la CE 15 Decembre 2021

Date de début 1 Janvier 2022

Date de fin 30 Juin 2026

Financé au titre de

• INDUSTRIAL LEADERSHIP - Leadership in enabling and industrial technologies - Information and Communication Technologies (ICT)

Coût total

€ 5 944 726,25

Contribution de l’UE

€ 5 944 726,25

Coordonné par

UNIVERSITE DE GENEVE
Switzerland

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Demonstrators, pilots, prototypes (4)

Functional upgraded SLIDE

D4.2 (MONTH 32) FUNCTIONAL UPGRADED SLIDE prototype with improvements based on feedback from first biomedical applications

Research-grade SLIDE @ UzL

D24 MONTH 18 Researchgrade SLIDE system functional at UZL with high framerate and fast volumetric imaging

SWIM 2 @ UniGE

D23 MONTH 18 Second SWIM prototype installed at UniGE for photophysics assessment LAV

SLIDE laboratory prototype (v1.0)

D31 MONTH 18 SLIDE laboratory prototype v10 ready to ship to UniGE month 18 and KUL month 21

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

D81 Completion of the Data Management Plan in agreement with the FAIR Findable Accessible Interoperable and Reusable principles

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

FAIR CHARM website

D71 MONTH 3 FAIR CHARM website online

Other (1)

3D annotation software ready

D25 MONTH 18 3D annotation software and domain specific 3D image processing tools ready

Publications

Peer reviewed articles (9)

Nucleus segmentation: towards automated solutions

Auteurs: R. Hollandi, N. Moshkov, L. Paavolainen, E. Tasnadi, F. Piccinini, P. Horvath
Publié dans: Trends in Cell Biology, Numéro 32, 2022, Page(s) 295-310, ISSN 1879-3088
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.tcb.2021.12.004

Nutrients activate distinct patterns of small-intestinal enteric neurons

Auteurs: Candice Fung, Tom Venneman, Amy M. Holland, Tobie Martens, Milvia I. Alata, Marlene M. Hao, Ceyhun Alar, Yuuki Obata, Jan Tack, Alejandro Sifrim, Vassilis Pachnis, Werend Boesmans, Pieter Vanden Berghe
Publié dans: Nature, Numéro 644, 2025, Page(s) 1069-1077, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09228-z

The Effect of a Lipid Surface Coating on the Permeation of Upconverting Nanoparticles through a 3D Human Lung Epithelial Model

Auteurs: Doyoung Kim, Gabrielle A. Mandl, Marta Balkota, Jimmy Vernaz, Song Huang, Samuel Constant, Pierre Maechler, Christine DeWolf, John A. Capobianco, Luigi Bonacina
Publié dans: Advanced Functional Material, 2024, Page(s) 2310078, ISSN 1616-301X
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202310078

Multi-Harmonic Imaging-Based Automated Recognition of Cutaneous T-Cell Lymphoma

Auteurs: Shayantani Ghosh, Olesya Pavlova, Alexandra Latshaw, Doyoung Kim, Christoph Iselin, Pauline Bernard, Pacome Prompsy, Yun-Tsan Chang, Davide Staedler, Yi-Chien Tsai, Luigi Bonacina, Emmanuella Guenova
Publié dans: British Journal of Dermatology, 2025, ISSN 0007-0963
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1093/bjd/ljaf345

Effect of tissue fixation on the optical properties of structural components assessed by non-linear microscopy imaging

Auteurs: M. Andrea Markus, Daniele P. Ferrari, Frauke Alves, Fernanda Ramos-Gomes
Publié dans: Biomedical Optics Express, Numéro 14(8), 2023, Page(s) 3988-4002, ISSN 2156-7085
Éditeur: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.488453

Cell segmentation and representation with shape priors

Auteurs: D. Hirling, P. Horvath
Publié dans: Computational and Structural Biotechnology Journal, Numéro 21, 2022, Page(s) 742-750, ISSN 2001-0370
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.12.034

Harmonic Imaging of Stem Cells in Whole Blood at GHz Pixel Rate

Auteurs: Sebastian Karpf, Nina Glöckner Burmeister, Laurence Dubreil, Shayantani Ghosh, Reka Hollandi, Julien Pichon, Isabelle Leroux, Alessandra Henkel, Valerie Lutz, Jonas Jurkevičius, Alexandra Latshaw, Vasyl Kilin, Tonio Kutscher, Moritz Wiggert, Oscar Saavedra-Villanueva, Alfred Vogel, Robert A. Huber, Peter Horvath, Karl Rouger, Luigi Bonacina
Publié dans: Small, 2024, ISSN 1613-6810
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202401472

Broadband frequency-doubling of a swept-source laser from 1550 nm to 775 nm using a fan-out crystal and application in 2kHz LiDAR ranging

Auteurs: Tonio F. Kutscher, Christian Stock, Florian Sommer, Jonas Jurkevicius, Stefan Meyer, Moritz Wiggert, Philipp Lamminger, Sebastian Karpf
Publié dans: Optics Express, Numéro 33, 2025, Page(s) 10637, ISSN 1094-4087
Éditeur: Optical Society of America
DOI: 10.1364/oe.541976

Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity

Auteurs: Andreas Mund, Fabian Coscia, András Kriston, Réka Hollandi, Ferenc Kovács, Andreas-David Brunner, Ede Migh, Lisa Schweizer, Alberto Santos, Michael Bzorek, Soraya Naimy, Lise Mette Rahbek-Gjerdrum, Beatrice Dyring-Andersen, Jutta Bulkescher, Claudia Lukas, Mark Adam Eckert, Ernst Lengyel, Christian Gnann, Emma Lundberg, Peter Horvath, Matthias Mann
Publié dans: Nature Biotechnology, Numéro 40, 2022, Page(s) 1231–1240, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-022-01302-5