Pancreatic cancer AI for genomics and personalized Medicine

Informations projet

PANCAIM

N° de convention de subvention: 101016851

DOI

10.3030/101016851

Projet clôturé

Date de signature de la CE 4 Decembre 2020

Date de début 1 Janvier 2021

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• SOCIETAL CHALLENGES - Health, demographic change and well-being

Coût total

€ 8 236 378,75

Contribution de l’UE

€ 8 236 378,75

Coordonné par

STICHTING RADBOUD UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM
Netherlands

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project webpage

Description of the PANCAIM webpage that will be prepared in the first months of the project

Other (1)

Open-source prediction algorithms beta-tested and made available in GitHub

Prediction algorithms tested by the end-user group, and the source codes of the algorithms made available for community use

Documents, reports (1)

Dissemination and communication strategy

The definition of the dissemination and communication strategy and tools to be used during the life of the project All possible dissemination routes for the obtained results will be identified and used during the whole course of the project

Publications

Peer reviewed articles (13)

Automatic quantification of tumor-stroma ratio as a prognostic marker for pancreatic cancer

Auteurs: Pierpaolo Vendittelli, John-Melle Bokhorst, Esther M. M. Smeets, Valentyna Kryklyva, Lodewijk A. A. Brosens, Caroline Verbeke, Geert Litjens
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 19, 2024, Page(s) e0301969, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0301969

Prediction Variability to Identify Reduced AI Performance in Cancer Diagnosis at MRI and CT

Auteurs: Natália Alves, Joeran S. Bosma, Kiran V. Venkadesh, Colin Jacobs, Zaigham Saghir, Maarten de Rooij, John Hermans, Henkjan Huisman
Publié dans: Radiology, Numéro 308, 2023, ISSN 0033-8419
Éditeur: Radiological Society of North America
DOI: 10.1148/radiol.230275

Artificial Intelligence in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Imaging: A Commentary on Potential Future Applications

Auteurs: Megan Schuurmans, Natália Alves, Pierpaolo Vendittelli, Henkjan Huisman, John Hermans, PANCAIM Consortium
Publié dans: Gastroenterology, Numéro Volume 165, Numéro 2, 2023, Page(s) 309-316, ISSN 1528-0012
Éditeur: American Gastroenterological Association
DOI: 10.1053/j.gastro.2023.04.003

Pancreatic Cancer From the Patient Perspective: The Time to Act is Now

Auteurs: Marianna Vitaloni, Patrick Michl, Matthias Löhr, Ali Stunt, Patrycja Rzadkowska, Eva Backman, Lama Sharara, Vitor Neves, Thomas Gruenberger, Zorana Maravic
Publié dans: Journal of Patient Experience, Numéro 9, 2025, ISSN 2374-3735
Éditeur: SAGE Publications
DOI: 10.1177/23743735221112633

A fusion-based deep-learning algorithm predicts PDAC metastasis based on primary tumour CT images: a multinational study

Auteurs: Nannan Xue, Sergio Sabroso-Lasa, Xavier Merino, Maria Munzo-Beltran, Megan Schuurmans, Maria Olano, Lidia Estudillo, Maria Jesús Ledesma-Carbayo, Junqi Liu, Ruitai Fan, John J Hermans, Casper van Eij
Publié dans: Gut, Numéro 74, 2025, Page(s) 2024-2034, ISSN 0017-5749
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2024-334237

The DRAGON benchmark for clinical NLP

Auteurs: Joeran S. Bosma, Koen Dercksen, Luc Builtjes, Romain André, Christian Roest, Stefan J. Fransen, Constant R. Noordman, Mar Navarro-Padilla, Judith Lefkes, Natália Alves, Max J. J. de Grauw, Leander v
Publié dans: npj Digital Medicine, Numéro 8, 2025, ISSN 2398-6352
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41746-025-01626-x

Can our experience with surveillance for inherited pancreatic cancer help to identify early pancreatic cancer in the general population?

Auteurs: J.-Matthias Löhr, Daniel Öhlund, Emma Söreskog, Emil Andersson, Miroslav Vujasinovic, Niklas Zethraeus, Malin Sund
Publié dans: Familial Cancer, Numéro 23, 2024, Page(s) 399-403, ISSN 1389-9600
Éditeur: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10689-024-00363-6

Pancreatic incidentaloma: incidental findings from history towards the era of liquid biopsy

Auteurs: J-Matthias Löhr, Miroslav Vujasinovic, Nikolaos Kartalis, Philipp Osten
Publié dans: eGastroenterology, Numéro 2, 2025, Page(s) e100082, ISSN 2766-0125
Éditeur: BMJ
DOI: 10.1136/egastro-2024-100082

Explainable multi-omics deep clustering model reveals an important role of DNA methylation in pancreatic ductal adenocarcinoma

Auteurs: Alberto López, John Zobolas, Ole Christian Lingjærde, Daniel Nebdal, Thomas Fleischer, Tero Aittokallio
Publié dans: Nordic Machine Intelligence, Numéro 4, 2024, Page(s) 26-42, ISSN 2703-9196
Éditeur: University of Oslo Library
DOI: 10.5617/nmi.10584

End-to-end prognostication in pancreatic cancer by multimodal deep learning: a retrospective, multicenter study

Auteurs: Megan Schuurmans, Anindo Saha, Natália Alves, Pierpaolo Vendittelli, Derya Yakar, Sergio Sabroso-Lasa, Nannan Xue, Núria Malats, Henkjan Huisman, John Hermans, Geert Litjens
Publié dans: European Radiology, Numéro 35, 2025, Page(s) 7537-7548, ISSN 1432-1084
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s00330-025-11694-y

Fully Automatic Deep Learning Framework for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Detection on Computed Tomography

Auteurs: Natália Alves; Megan Schuurmans; Geke Litjens; Joeran S. Bosma; John Hermans; Henkjan J. Huisman
Publié dans: Cancers, Numéro 14(2), 376, 2022, ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14020376

Mutational signature dynamics indicate SARS-CoV-2’s evolutionary capacity is driven by host antiviral molecules

Auteurs: Kieran D. Lamb, Martha M. Luka, Megan Saathoff, Richard J. Orton, My V. T. Phan, Matthew Cotten, Ke Yuan, David L. Robertson
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 20, 2024, Page(s) e1011795, ISSN 1553-7358
Éditeur: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011795

Setting the Research Agenda for Clinical Artificial Intelligence in Pancreatic Adenocarcinoma Imaging

Auteurs: Megan Schuurmans; Natália Alves; Pierpaolo Vendittelli; Henkjan Huisman; John Hermans
Publié dans: Cancers, Numéro 14(14), 3498, 2022, ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14143498

Other (4)

Tutorial on survival modelling with omics data

Auteurs: Zhi Zhao, John Zobolas, Manuela Zucknick, Tero Aittokallio
Publié dans: 2023
Éditeur: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2302.12542

Deliverable D4.1: Open-source prediction algorithms beta-tested and made available in GitHub

Auteurs: Zobolas, John; Aittokallio, Tero
Publié dans: Numéro 7, 2023
Éditeur: PANCAIM Consortium
DOI: 10.5281/zenodo.8119247

Automatic quantification of TSR as a prognostic marker for pancreatic cancer.

Auteurs: Pierpaolo Vendittelli, John-Melle Bokhorst, Esther Smeets, Valentyna Kryklyva, Lodewijk Brosens, Caroline Verbeke, Geert Litjens
Publié dans: 2023
Éditeur: Research Square Platform LLC
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3307605/v1

An example Machine Learning Survival Workflow

Auteurs: Zobolas, John
Publié dans: Numéro 1, 2022
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.8060668

Conference proceedings (1)

Automatic tumour segmentation in H&E-stained whole-slide images of the pancreas.

Auteurs: Vendittelli, Pierpaolo; Smeets, Esther M. M.; Litjens, Geert
Publié dans: Proceedings of the SPIE, Volume 12039, 2022
Éditeur: SPIE
DOI: 10.1117/12.2611542