Pancreatic cancer AI for genomics and personalized Medicine

Projektinformationen

PANCAIM

ID Finanzhilfevereinbarung: 101016851

DOI

10.3030/101016851

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 4 Dezember 2020

Startdatum 1 Januar 2021

Enddatum 30 September 2025

Finanziert unter

• SOCIETAL CHALLENGES - Health, demographic change and well-being

Gesamtkosten

€ 8 236 378,75

EU-Beitrag

€ 8 236 378,75

Koordiniert durch

STICHTING RADBOUD UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project webpage

Description of the PANCAIM webpage that will be prepared in the first months of the project

Other (1)

Open-source prediction algorithms beta-tested and made available in GitHub

Prediction algorithms tested by the end-user group, and the source codes of the algorithms made available for community use

Documents, reports (1)

Dissemination and communication strategy

The definition of the dissemination and communication strategy and tools to be used during the life of the project All possible dissemination routes for the obtained results will be identified and used during the whole course of the project

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (13)

Automatic quantification of tumor-stroma ratio as a prognostic marker for pancreatic cancer

Autoren: Pierpaolo Vendittelli, John-Melle Bokhorst, Esther M. M. Smeets, Valentyna Kryklyva, Lodewijk A. A. Brosens, Caroline Verbeke, Geert Litjens
Veröffentlicht in: PLOS ONE, Ausgabe 19, 2024, Seite(n) e0301969, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0301969

Prediction Variability to Identify Reduced AI Performance in Cancer Diagnosis at MRI and CT

Autoren: Natália Alves, Joeran S. Bosma, Kiran V. Venkadesh, Colin Jacobs, Zaigham Saghir, Maarten de Rooij, John Hermans, Henkjan Huisman
Veröffentlicht in: Radiology, Ausgabe 308, 2023, ISSN 0033-8419
Herausgeber: Radiological Society of North America
DOI: 10.1148/radiol.230275

Artificial Intelligence in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Imaging: A Commentary on Potential Future Applications

Autoren: Megan Schuurmans, Natália Alves, Pierpaolo Vendittelli, Henkjan Huisman, John Hermans, PANCAIM Consortium
Veröffentlicht in: Gastroenterology, Ausgabe Volume 165, Ausgabe 2, 2023, Seite(n) 309-316, ISSN 1528-0012
Herausgeber: American Gastroenterological Association
DOI: 10.1053/j.gastro.2023.04.003

Pancreatic Cancer From the Patient Perspective: The Time to Act is Now

Autoren: Marianna Vitaloni, Patrick Michl, Matthias Löhr, Ali Stunt, Patrycja Rzadkowska, Eva Backman, Lama Sharara, Vitor Neves, Thomas Gruenberger, Zorana Maravic
Veröffentlicht in: Journal of Patient Experience, Ausgabe 9, 2025, ISSN 2374-3735
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/23743735221112633

A fusion-based deep-learning algorithm predicts PDAC metastasis based on primary tumour CT images: a multinational study

Autoren: Nannan Xue, Sergio Sabroso-Lasa, Xavier Merino, Maria Munzo-Beltran, Megan Schuurmans, Maria Olano, Lidia Estudillo, Maria Jesús Ledesma-Carbayo, Junqi Liu, Ruitai Fan, John J Hermans, Casper van Eij
Veröffentlicht in: Gut, Ausgabe 74, 2025, Seite(n) 2024-2034, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2024-334237

The DRAGON benchmark for clinical NLP

Autoren: Joeran S. Bosma, Koen Dercksen, Luc Builtjes, Romain André, Christian Roest, Stefan J. Fransen, Constant R. Noordman, Mar Navarro-Padilla, Judith Lefkes, Natália Alves, Max J. J. de Grauw, Leander v
Veröffentlicht in: npj Digital Medicine, Ausgabe 8, 2025, ISSN 2398-6352
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41746-025-01626-x

Can our experience with surveillance for inherited pancreatic cancer help to identify early pancreatic cancer in the general population?

Autoren: J.-Matthias Löhr, Daniel Öhlund, Emma Söreskog, Emil Andersson, Miroslav Vujasinovic, Niklas Zethraeus, Malin Sund
Veröffentlicht in: Familial Cancer, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 399-403, ISSN 1389-9600
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10689-024-00363-6

Pancreatic incidentaloma: incidental findings from history towards the era of liquid biopsy

Autoren: J-Matthias Löhr, Miroslav Vujasinovic, Nikolaos Kartalis, Philipp Osten
Veröffentlicht in: eGastroenterology, Ausgabe 2, 2025, Seite(n) e100082, ISSN 2766-0125
Herausgeber: BMJ
DOI: 10.1136/egastro-2024-100082

Explainable multi-omics deep clustering model reveals an important role of DNA methylation in pancreatic ductal adenocarcinoma

Autoren: Alberto López, John Zobolas, Ole Christian Lingjærde, Daniel Nebdal, Thomas Fleischer, Tero Aittokallio
Veröffentlicht in: Nordic Machine Intelligence, Ausgabe 4, 2024, Seite(n) 26-42, ISSN 2703-9196
Herausgeber: University of Oslo Library
DOI: 10.5617/nmi.10584

End-to-end prognostication in pancreatic cancer by multimodal deep learning: a retrospective, multicenter study

Autoren: Megan Schuurmans, Anindo Saha, Natália Alves, Pierpaolo Vendittelli, Derya Yakar, Sergio Sabroso-Lasa, Nannan Xue, Núria Malats, Henkjan Huisman, John Hermans, Geert Litjens
Veröffentlicht in: European Radiology, Ausgabe 35, 2025, Seite(n) 7537-7548, ISSN 1432-1084
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s00330-025-11694-y

Fully Automatic Deep Learning Framework for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Detection on Computed Tomography

Autoren: Natália Alves; Megan Schuurmans; Geke Litjens; Joeran S. Bosma; John Hermans; Henkjan J. Huisman
Veröffentlicht in: Cancers, Ausgabe 14(2), 376, 2022, ISSN 2072-6694
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14020376

Mutational signature dynamics indicate SARS-CoV-2’s evolutionary capacity is driven by host antiviral molecules

Autoren: Kieran D. Lamb, Martha M. Luka, Megan Saathoff, Richard J. Orton, My V. T. Phan, Matthew Cotten, Ke Yuan, David L. Robertson
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 20, 2024, Seite(n) e1011795, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011795

Setting the Research Agenda for Clinical Artificial Intelligence in Pancreatic Adenocarcinoma Imaging

Autoren: Megan Schuurmans; Natália Alves; Pierpaolo Vendittelli; Henkjan Huisman; John Hermans
Veröffentlicht in: Cancers, Ausgabe 14(14), 3498, 2022, ISSN 2072-6694
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14143498

Other (4)

Tutorial on survival modelling with omics data

Autoren: Zhi Zhao, John Zobolas, Manuela Zucknick, Tero Aittokallio
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2302.12542

Deliverable D4.1: Open-source prediction algorithms beta-tested and made available in GitHub

Autoren: Zobolas, John; Aittokallio, Tero
Veröffentlicht in: Ausgabe 7, 2023
Herausgeber: PANCAIM Consortium
DOI: 10.5281/zenodo.8119247

Automatic quantification of TSR as a prognostic marker for pancreatic cancer.

Autoren: Pierpaolo Vendittelli, John-Melle Bokhorst, Esther Smeets, Valentyna Kryklyva, Lodewijk Brosens, Caroline Verbeke, Geert Litjens
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Research Square Platform LLC
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3307605/v1

An example Machine Learning Survival Workflow

Autoren: Zobolas, John
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2022
Herausgeber: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.8060668

Conference proceedings (1)

Automatic tumour segmentation in H&E-stained whole-slide images of the pancreas.

Autoren: Vendittelli, Pierpaolo; Smeets, Esther M. M.; Litjens, Geert
Veröffentlicht in: Proceedings of the SPIE, Volume 12039, 2022
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.2611542