CBASS: Life, Death and cyclic nucleotides

Informations projet

CBASS

N° de convention de subvention: 101018608

DOI

10.3030/101018608

Date de signature de la CE 15 Juillet 2021

Date de début 1 Août 2021

Date de fin 31 Janvier 2027

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 785 866,00

Contribution de l’UE

€ 1 785 866,00

Coordonné par

THE UNIVERSITY COURT OF THE UNIVERSITY OF ST ANDREWS
United Kingdom

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Publications

Peer reviewed articles (15)

Antiviral signaling by a cyclic nucleotide activated CRISPR protease

Auteurs: Christophe Marcel Joseph Rouillon, Niels Schneberger, Haotian Chi, Katja Blumenstock, Stefano Da Vela, Katrin Ackermann, Jonas Moecking, Martin F. Peter, Wolfgang Boenigk, Reinhard Seifert, Bela Ernest Bode, Jonathan L. Schmid-Burgk, Dmitri Svergun, Matthias Geyer, Malcolm F. White, Gregor Hageluken
Publié dans: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05571-7

SAM-AMP lyases in type III CRISPR defence

Auteurs: Haotian Chi, Stephen McMahon, Lukas Daniel-Pedersen, Shirley Graham, Tracey M Gloster, Malcolm F White
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf655

Activation of Csm6 ribonuclease by cyclic nucleotide binding: in an emergency, twist to open

Auteurs: Stuart McQuarrie; Januka S Athukoralage; Stephen A McMahon; Shirley Graham; Katrin Ackermann; Bela E Bode; Malcolm F White; Tracey M Gloster
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2023, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad739

Structure and mechanism of the broad spectrum CRISPR-associated ring nuclease Crn4

Auteurs: Haotian Chi, Ville Hoikkala, Stephen McMahon, Shirley Graham, Tracey Gloster, Malcolm F. White
Publié dans: Nature Communications, Numéro 17, 2026, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-67607-6

Cyclic nucleotide signaling in phage defense and counter-defense

Auteurs: Januka S. Athukoralage and Malcolm F. White
Publié dans: Annual Reviews in Virology, Numéro 9, 2022, Page(s) 451-468, ISSN 2327-056X
Éditeur: Annual Reviews
DOI: 10.1146/annurev-virology-100120-010228

A viral SAVED protein with ring nuclease activity degrades the CRISPR second messenger cA4

Auteurs: Marta Orzechowski, Ville Hoikkala, Haotian Chi, Stephen McMahon, Tracey Gloster, Malcolm F White
Publié dans: Biochemical Journal, Numéro 482, 2025, Page(s) 1707-1719, ISSN 0264-6021
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bcj20253271

Structure of the Saccharolobus solfataricus type III-D CRISPR effector

Auteurs: Giuseppe Cannone, Dmytro Kompaniiets, Shirley Graham, Malcolm F White, Laura Spagnolo
Publié dans: Current Research in Structural Biology, Numéro 5, 2023, Page(s) 100098, ISSN 2665-928X
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.crstbi.2023.100098

CRISPR antiphage defence mediated by the cyclic nucleotide-binding membrane protein Csx23

Auteurs: Sabine Grüschow, Stuart McQuarrie, Katrin Ackermann, Stephen McMahon, Bela E Bode, Tracey M Gloster, Malcolm F White
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 52, 2024, Page(s) 2761-2775, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae167

Bioinformatic analysis of type III CRISPR systems reveals key properties and new effector families

Auteurs: Ville Hoikkala, Shirley Graham, Malcolm F White
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 52, 2024, Page(s) 7129-7141, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae462

Reversible conjugation of a CBASS nucleotide cyclase regulates bacterial immune response to phage infection

Auteurs: Larissa Krüger, Laura Gaskell-Mew, Shirley Graham, Sally Shirran, Robert Hertel, Malcolm F. White
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 9, 2024, Page(s) 1579-1592, ISSN 2058-5276
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-024-01670-5

Cas10 based 7SL-sRNA diagnostic for the detection of active trypanosomosis

Auteurs: Sabine Grüschow, Pieter C. Steketee, Edith Paxton, Keith R. Matthews, Liam J. Morrison, Malcolm F. White, Finn Grey
Publié dans: PLOS Neglected Tropical Diseases, Numéro 19, 2025, Page(s) e0012937, ISSN 1935-2735
Éditeur: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pntd.0012937

Diversity and abundance of ring nucleases in type III CRISPR-Cas loci

Auteurs: Ville Hoikkala, Haotian Chi, Sabine Grüschow, Shirley Graham, Malcolm F White
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 380, 2025, ISSN 0962-8436
Éditeur: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2024.0084

Cyclic nucleotide-induced helical structure activates a TIR immune effector

Auteurs: Gaëlle Hogrel, Abbie Guild, Shirley Graham, Hannah Rickman, Sabine Grüschow, Quentin Bertrand, Laura Spagnolo, Malcolm F. White
Publié dans: Nature, Numéro 608, 2022, Page(s) 808-812, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05070-9

Antiviral Type III CRISPR signalling via conjugation of ATP and AdoMet

Auteurs: Haotian Chi; Ville Hoikkala; Sabine Grüschow; Shirley Graham; Sally Shirran; Malcolm F White
Publié dans: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.06.26.546636

RNA processing by the CRISPR-associated NYN ribonuclease

Auteurs: Haotian Chi, Malcolm F. White
Publié dans: Biochemical Journal, Numéro 481, 2024, Page(s) 793-804, ISSN 0264-6021
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bcj20240151