Description du projet
Rôle des alarmones de diadénosine polyphosphate dans les modifications post-traductionnelles du protéome
La complexité de l’information du génome au protéome est considérablement accrue par les modifications post-traductionnelles (PTM), qui sont des modifications covalentes des polypeptides après la synthèse des protéines. Le projet AMP-Alarm financé par l’UE fera la lumière sur le rôle cellulaire des diadénosine polyphosphates (ApnAs), formés en réponse au stress et appelés alarmones, et sur leur implication dans la modification des protéines cibles par l’adénosine monophosphate (AMPylation), un processus PTM. L’objectif est d’identifier et de caractériser de nouveaux protagonistes de l’AMPylation et d’étudier leurs interactions avec les ApnAs, par le biais d’analyses protéomiques dans des cellules vivantes. Le projet comprendra l’étude d’une protéine déjà identifiée avec des sondes basées sur les ApnAs comme une ARN ligase 5’-3’, la première trouvée dans les cellules humaines, qui est impliquée dans le cancer et la neurodégénerescence.
Objectif
"It is puzzling that the human genome has only slightly more genes than the fruit fly and only half the number of cauliflower. Obviously, the sheer number of genes alone cannot determine the complexity of human development and the sophisticated signalling systems that maintain homeostasis. In fact, the complexity of information from genome to proteome is greatly increased. Drivers for the complexity of the proteome are posttranslational modifications (PTMs), i.e. covalent modifications of polypeptides after translation.
The aim of this project is to shine light on a scientific mystery known for decades. We will elucidate the cellular roles and functions of diadenosine polyphosphates (ApnAs), which are formed in response to stress and are therefore called ""alarmones"", and their interactions with the PTM processes ""AMPylation"", i.e. the covalent modification of the target protein by adenosine monophosphate. Although both topics are known for more than 60 years, their molecular mechanism and functions are poorly understood.
Based on our preliminary results, which unambiguously show the interplay of ApnAs and AMPylation for the first time, we will search for, identify and characterize new protagonists of AMPylation and clarify their interactions with ApnAs. Therefore, new chemical tools will be developed and applied in the proteome-wide studies in living cells.
We will also investigate the molecular function of a protein that we have already identified with ApnA-based probes. We have discovered that this protein is a ""5'-3' RNA ligase"", the first one found in human cells! The available data indicates the involvement of this RNA ligase in cancer and neurodegeneration, and we will therefore elucidate the molecular mechanisms and functions of this protein in detail.
Overall, this project will bring significant new and previously unexplored advances and will provide a guideline for future translational research in the fight against diseases."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques neurobiologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture horticulture fruiticulture
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
78464 Konstanz
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.