Description du projet
Aperçu mécanistique de la réparation de l’ADN
Pour assurer une transmission haute fidélité de l’information génétique, les cellules eucaryotes ont développé des mécanismes pour réparer les dommages à l’ADN, tels que les cassures double brin (CDB), causées par les rayonnements ionisants. La voie de recombinaison homologue est un mécanisme clé de réparation de l’ADN qui utilise le chromosome intact comme modèle pour restaurer les informations manquantes. Le projet DSB Architect, financé par l’UE, entend comprendre le rôle de la conformation chromosomique 3D dans ce processus. Les chercheurs développeront une nouvelle technologie pour caractériser les interactions intermoléculaires et intramoléculaires et identifier les protéines clés responsables de la conformation des chromosomes.
Objectif
The integrity of eukaryotic genomes is constantly challenged by various endogenous and exogenous insults, whereby DNA double-strand breaks (DSBs) are particularly problematic. DSBs can be repaired by multiple pathways, but only the homologous recombination (HR) pathway ensures error-free repair. HR restores missing information around the lesion based on topological interactions with a homologous region on a distinct DNA molecule. HR-directed repair can function across homologous chromosomes in diploid organisms, but is much more efficient between sister chromatids in replicated chromosomes, indicating an important role of chromosome conformation in repair. Sister chromatids are organized by a dynamic interplay between cohesin-mediated loop extrusion, cohesin-mediated sister linkage, and chromatin-based affinity interactions. How these activities shape sister chromatids to support DNA repair is unclear. The proposed project aims to reveal how sister chromatid conformation governs DSB repair efficiency and pathway choice in human cells and to identify and characterize the key molecular factors regulating chromosome conformation for efficient DSB repair. Understanding how intra- and inter-molecular topological interactions contribute to DNA repair will become possible by using a new chromosome conformation capture technology developed in the hosting lab (sister-chromatid sensitive Hi-C). This technology will be combined with a system for acute DSB induction, automated imaging and genomic profiling of DNA repair factors, and targeted protein degradation of cohesin and its regulators to elucidate topological interactions underlying DSB repair. The proposed project will provide insights into how the core machinery shaping the three-dimensional organization of chromosomes contributes to the maintenance of genome integrity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturellessciences biologiquesgénétiqueADN
- sciences naturellessciences biologiquesbiochimiebiomoléculeprotéines
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquechromosome
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquegénomegénome eucaryote
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Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1030 Wien
Autriche