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Palaeogenomes of a lost world: Ancient bovids of the submerged Palaeo-Agulhas Plain of southern Africa

Descripción del proyecto

Caracterización genética de bóvidos africanos antiguos

La reciente caracterización paleoecológica de la llanura de inundación de Palaeo-Agulhas (Sudáfrica) permitió ubicar las colecciones subfósiles de bóvidos africanos en un contexto ambiental y temporal significativo. Sin embargo, se carece de una caracterización genética de sus mamíferos. En el proyecto PalaeoBovids, financiado con fondos europeos, se utilizarán técnicas paleogenómicas para generar datos genómicos mitocondriales antiguos de seis especies de bóvidos africanos que relacionen cinco períodos temporales de los últimos cien mil años. El equipo del proyecto, que se llevará a cabo en el Instituto GLOBE (Universidad de Copenhague), utilizará estos datos para investigar los factores determinantes de los cambios temporales en la diversidad genética: la aparición del pastoreo, la caza excesiva por parte de los colonos, la fragmentación reciente de la población y los efectos en los distintos grupos de alimentación. PalaeoBovids mejorará la comprensión del impacto del clima, las enfermedades y los seres humanos en la extinción de especies.

Objetivo

The recent, detailed palaeoecological characterisation of a drowned ecosystem off the southern coast of Africa, known as the Palaeo-Agulhas Plain (PAP), has placed subfossil collections of African bovids from archaeological sites along this coast into meaningful environmental and temporal context. For the excellent work done to describe this palaeoecosystem, genetic characterisation of the mammals that roamed its plains is lacking, despite an abundance of subfossils available. In this Action, I will use palaeogenomics techniques to generate ancient mitochondrial genomic data of six African bovid species spanning five time periods over the past ~100,000 years, including the present. The target species represent three broad feeding guilds: grazers- Cape buffalo, long-horned buffalo (extinct) and southern reedbuck, a mixed feeder- common eland, and browsers- grey rhebok and Cape grysbok. These data will be used to investigate drivers of temporal changes in genetic diversity, such as climate change, range-size change due to the emergence and submergence of the PAP with changing sea levels, the emergence of pastoralism in human societies, over-hunting by colonial settlers, and recent population fragmentation, and whether different feeding guilds were affected discordantly. The project will be hosted by Assoc. Prof. Eline Lorenzen, a respected expert in the field of African bovid phylogeography and ancient DNA, at the GLOBE Institute at the University of Copenhagen, which houses a world-leading ancient DNA facility. This Action will improve my current scientific and transferable skills and will provide the opportunity for me to learn valuable new skills that will considerably enhance my future career prospects. In this Action, I will generate the first population-level palaeogenomic data of wildlife from southern Africa and contribute novel and valuable insights into the population dynamics of African bovids in relation to climate, humans, disease and extinction.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.

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Coordinador

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Aportación neta de la UEn
€ 219 312,00
Dirección
NORREGADE 10
1165 Kobenhavn
Dinamarca

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Región
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 219 312,00