Description du projet
Caractérisation génétique des anciens bovidés africains
La récente caractérisation paléoécologique de la plaine submergée de Palaeo-Agulhas (PAP, au large de l’Afrique du Sud) a inscrit les collections subfossiles de bovidés africains dans un contexte environnemental et temporel important. La caractérisation génétique des mammifères fait toutefois défaut. Le projet PalaeoBovids, financé par l’UE, utilisera des techniques paléogénomiques pour générer des données génomiques mitochondriales anciennes de six espèces de bovidés africains faisant le lien entre cinq périodes différentes au cours de ces 100 000 dernières années. Le projet, hébergé par l’Institut GLOBE (Université de Copenhague), utilisera les données pour étudier les facteurs de changement temporel de la diversité génétique, à savoir l’émergence du pastoralisme, la chasse excessive pratiquée par les colons, la fragmentation récente de la population et les effets sur les différents lots d’alimentation. PalaeoBovids approfondira notre compréhension de l’impact du climat, des maladies et de l’homme sur l’extinction des espèces.
Objectif
The recent, detailed palaeoecological characterisation of a drowned ecosystem off the southern coast of Africa, known as the Palaeo-Agulhas Plain (PAP), has placed subfossil collections of African bovids from archaeological sites along this coast into meaningful environmental and temporal context. For the excellent work done to describe this palaeoecosystem, genetic characterisation of the mammals that roamed its plains is lacking, despite an abundance of subfossils available. In this Action, I will use palaeogenomics techniques to generate ancient mitochondrial genomic data of six African bovid species spanning five time periods over the past ~100,000 years, including the present. The target species represent three broad feeding guilds: grazers- Cape buffalo, long-horned buffalo (extinct) and southern reedbuck, a mixed feeder- common eland, and browsers- grey rhebok and Cape grysbok. These data will be used to investigate drivers of temporal changes in genetic diversity, such as climate change, range-size change due to the emergence and submergence of the PAP with changing sea levels, the emergence of pastoralism in human societies, over-hunting by colonial settlers, and recent population fragmentation, and whether different feeding guilds were affected discordantly. The project will be hosted by Assoc. Prof. Eline Lorenzen, a respected expert in the field of African bovid phylogeography and ancient DNA, at the GLOBE Institute at the University of Copenhagen, which houses a world-leading ancient DNA facility. This Action will improve my current scientific and transferable skills and will provide the opportunity for me to learn valuable new skills that will considerably enhance my future career prospects. In this Action, I will generate the first population-level palaeogenomic data of wildlife from southern Africa and contribute novel and valuable insights into the population dynamics of African bovids in relation to climate, humans, disease and extinction.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Programme(s)
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1165 Kobenhavn
Danemark