Projektbeschreibung
Genetische Charakterisierung alter afrikanischer Rinderarten
Durch die jüngst erfolgte paläo-ökologische Charakterisierung des heute von Meer bedeckten Paläo-Agulhas-Plateaus (PAP, Südafrika) konnten subfossile Sammlungen afrikanischer Rinder in einen bedeutsamen ökologischen und zeitlichen Kontext eingeordnet werden. Eine genetische Charakterisierung von Säugetieren erfolgte bislang allerdings nicht. Das EU-finanzierte Projekt PalaeoBovids generiert mit paläo-genomischen Methoden Daten zu fossilen mitochondrialen Genomen von sechs afrikanischen Rinderarten aus fünf Zeitabschnitten der letzten 100 000 Jahre. Das vom GLOBE Institute (Universität Kopenhagen) koordinierte Projekt erforscht mithilfe dieser Daten die Ursachen zeitlicher Veränderungen der genetischen Vielfalt, d. h. den Übergang zur Viehzucht, Überjagung im Zuge von Kolonialisierung, neuere Fragmentierungen von Populationen sowie Unterschiede in der Tiernahrung. PalaeoBovids liefert damit neue Erkenntnisse zum Einfluss von Klima, Krankheiten und menschlichen Aktivitäten auf das Artensterben.
Ziel
The recent, detailed palaeoecological characterisation of a drowned ecosystem off the southern coast of Africa, known as the Palaeo-Agulhas Plain (PAP), has placed subfossil collections of African bovids from archaeological sites along this coast into meaningful environmental and temporal context. For the excellent work done to describe this palaeoecosystem, genetic characterisation of the mammals that roamed its plains is lacking, despite an abundance of subfossils available. In this Action, I will use palaeogenomics techniques to generate ancient mitochondrial genomic data of six African bovid species spanning five time periods over the past ~100,000 years, including the present. The target species represent three broad feeding guilds: grazers- Cape buffalo, long-horned buffalo (extinct) and southern reedbuck, a mixed feeder- common eland, and browsers- grey rhebok and Cape grysbok. These data will be used to investigate drivers of temporal changes in genetic diversity, such as climate change, range-size change due to the emergence and submergence of the PAP with changing sea levels, the emergence of pastoralism in human societies, over-hunting by colonial settlers, and recent population fragmentation, and whether different feeding guilds were affected discordantly. The project will be hosted by Assoc. Prof. Eline Lorenzen, a respected expert in the field of African bovid phylogeography and ancient DNA, at the GLOBE Institute at the University of Copenhagen, which houses a world-leading ancient DNA facility. This Action will improve my current scientific and transferable skills and will provide the opportunity for me to learn valuable new skills that will considerably enhance my future career prospects. In this Action, I will generate the first population-level palaeogenomic data of wildlife from southern Africa and contribute novel and valuable insights into the population dynamics of African bovids in relation to climate, humans, disease and extinction.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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