Descripción del proyecto
Estudiar el movimiento del ADN a nivel atómico
Datos recientes indican que las moléculas de ADN (DNA, por sus siglas en inglés) tienen una flexibilidad conformacional, un atributo importante si se tiene en cuenta que el ADN interactúa con proteínas específicas. Esta flexibilidad está determinada en gran medida por la secuencia de ADN y también es fundamental para la expresión génica. Sin embargo, no hay información sobre la flexibilidad del ADN con lesiones como las roturas de doble cadena. El objetivo del proyecto HRRinDNAwithSSB, financiado con fondos europeos, es analizar la dinámica de la flexibilidad del ADN y cómo los movimientos que se producen a nanoescala influyen en esta propiedad. Los resultados ayudarán a los científicos a comprender los movimientos y la flexibilidad del ADN dañado y a desvelar cómo se repara.
Objetivo
What role do conformational dynamics play in DNA function and repair? Structures of DNA show local dynamics, conformational flexibility of bases, and large conformational changes in the double helix, indicating easily accessible motions. Yet studying fast motions in nucleic acids is challenging. To address this we will introduce High Resolution Relaxometry (HRR) and apply it to study single strand breaks (SSBs) in DNA. Nucleic acids are often studied at atomic resolution with X-ray crystallography and high-field Nuclear Magnetic Resonance (NMR). Yet neither is suitable to study ns-motions. X-ray crystallography does not report on dynamics while using high-field NMR leads to high resonance frequencies so little ns time-scale information is present. This presents a challenge: how to characterise fast motions in nucleic acids? We will develop a new methodological approach, HRR, to probe ns-motions in DNA. HRR was developed by the host team to study ns-motions in proteins. We will adapt these methods to investigate motions in DNA. We will compare dynamics occurring in intact DNA, DNA with a SSB and SSB DNA with a missing base. Understanding the motions in each DNA construct will establish the effects that each type of DNA damage have on the motional properties of DNA. This will elucidate how each type of damage affects the base pair stacking and the motions occurring at the breakpoint. Understanding the flexibility induced by DNA damage will have a significant role in understanding DNA repair and how damaged DNA is recognised. The DNA repair protein, PARP-1, is a cancer-drug target and recognizes SSBs. Our final objective is to uncover the role of DNA motions in SSB recognition by PARP-1. In summary we will develop HRR as a new method to investigate ns-motions in DNA, providing a general approach to study ns-motions in nucleic acids at atomic resolution. We will discover the fundamental motions in DNA, how they are affected by SSBs and lead to recognition by PARP-1.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas ácido nucleico
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias de la tierra y ciencias ambientales conexas geología mineralogía cristalografía
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2020
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75230 Paris
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.