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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Building a causal regulatory network of mesenchymal cells using targeted programming experiments

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

ChromatinHD connects single-cell DNA accessibility and conformation to gene expression through scale-adaptive machine learning (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Machine learning methods that fully exploit the dual modality of single-cell RNA+ATAC-seq techniques are still lacking. Here, we developed ChromatinHD, a pair of models that uses the raw accessibility data, with-out peak-calling or windows, to predict gene expression and determine differentially accessible chromatin. We show how both models consistently outperform existing peak and window-based ap
Publié dans: ChromatinHD connects single-cell DNA accessibility and conformation to gene expression through scale-adaptive machine learning, 2023, ISSN 2692-8205
Éditeur: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.07.21.549899

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