Building a causal regulatory network of mesenchymal cells using targeted programming experiments

Informazioni relative al progetto

DesignerCells

ID dell’accordo di sovvenzione: 101028476

DOI

10.3030/101028476

Progetto chiuso

Data della firma CE 22 Aprile 2021

Data di avvio 1 Settembre 2021

Data di completamento 31 Agosto 2023

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Costo totale

€ 203 149,44

Contributo UE

€ 203 149,44

Coordinato da

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Non-peer reviewed articles (1)

ChromatinHD connects single-cell DNA accessibility and conformation to gene expression through scale-adaptive machine learning

Autori: Machine learning methods that fully exploit the dual modality of single-cell RNA+ATAC-seq techniques are still lacking. Here, we developed ChromatinHD, a pair of models that uses the raw accessibility data, with-out peak-calling or windows, to predict gene expression and determine differentially accessible chromatin. We show how both models consistently outperform existing peak and window-based ap
Pubblicato in: ChromatinHD connects single-cell DNA accessibility and conformation to gene expression through scale-adaptive machine learning, 2023, ISSN 2692-8205
Editore: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.07.21.549899