Description du projet
Anticiper l’impact du changement climatique sur les interactions plantes-pathogènes
Les nombreuses études menées sur les interactions moléculaires entre les plantes et les pathogènes ont permis d’établir quelles combinaisons précises de gènes de l’hôte et du pathogène entraînent une sensibilité ou une résistance. Bien que précieux, les essais en laboratoire ne permettent pas de prédire directement quand et où une maladie se développera (pathogenèse) dans les populations végétales naturelles ou agricoles, car ils excluent les facteurs environnementaux qui jouent également un rôle. Le projet PathoGenoPredict, financé par l’UE, entend concevoir un cadre qui permettra aux scientifiques de prévoir la pathogenèse des végétaux en tenant compte de la variation, au sein du paysage et dans le temps, de la génétique des hôtes et des pathogènes. Le chargé de recherche étudiera l’interaction génétique entre Hyaloperonospora arabidopsidis, un organisme modèle de type champignon connu sous le nom d’oomycète, et la plante modèle Arabidopsis thaliana, dans différents espaces géographiques et produira des cartes valides à la fois pour le climat actuel et pour le climat modifié prévu pour l’avenir.
Objectif
Plants and their pathogens are locked in an ongoing coevolutionary battle, with outcomes affecting food and environmental security. Pathogenesis can occur when a host's resistance and pathogen's virulence genotypes are compatible with infection, while incompatible genotypes lead to resistance. A myriad of studies of molecular plant-pathogen interactions have probed the precise combinations of host (R) and pathogen (Avr) genes that lead to susceptibility or resistance. While laboratory trials are valuable, they cannot directly predict when and where pathogenesis will occur in natural or agricultural plant populations, as environmental factors also play a role. In this fellowship, I will build predictions of plant pathogenesis that account for spatiotemporal variation in both host and pathogen genetics over the landscape and through time.
I will investigate the model system of Hyaloperonospora arabidopsidis (Hpa; an oomycete) and Arabidopsis thaliana (Ath; a plant). Existing work in this system has identified the molecular mechanisms underlying multiple disease resistance phenotypes. I propose to extend this work by evaluating the genetic interaction of Hpa and Ath across the landscape. Specifically, I aim to
1) Determine the spatial distribution of genetic diversity across the landscape in both Ath and Hpa, investigating both neutral genome-wide patterns and R/Avr gene loci.
2) Model genetic variation in R/Avr genes across the landscape, producing maps both for today’s climate, and under predicted future climate change.
3) Predict how genetics interacts with a variable environment, including a changing climate, to produce disease, including future changes in the coevolutionary balance between plant and pathogen due to climate-induced range shifts.
These aims facilitate the projection of molecular plant-pathogen interactions onto the landscape, and provide a framework to examine the molecular mechanisms underlying ecological interaction of plants and their pathogens.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement sciences de l'atmosphère climatologie changement climatique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
80539 MUNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.