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C53 and Ufmylation Regulation In Endoplasmic Reticulum-Autophagy (ER-phagy)

Descripción del proyecto

Dilucidación del mecanismo de la autofagia en plantas

En griego, autofagia significa «comerse a uno mismo». Se trata de un mecanismo de control mediante el cual las células degradan y eliminan componentes celulares no deseados o dañados. Este proceso es muy selectivo y depende de la asociación entre dominios específicos de los receptores y la carga de autofagia. Los científicos del proyecto CURIE, financiado con fondos europeos, se proponen estudiar el papel de un receptor identificado hace poco y que está presente en el retículo endoplasmático. Caracterizarán genética y estructuralmente este receptor y dilucidarán su función en la especie modelo «Arabidopsis thaliana». Sus resultados podrían ayudar a mejorar la tolerancia al estrés en especies vegetales de cultivo.

Objetivo

Autophagy is a highly selective cellular quality control pathway. Selective removal of autophagic cargo are mediated by cargo receptors that contain cargo binding domains and ATG8 interacting motifs to bridge the cargo with autophagosomes. Although cargo receptors are the key players linking autophagy to cellular quality control, most of them are still waiting to be uncovered in plants. Identification and characterization of novel cargo receptors will pave the way for future translational studies that aim to enhance stress tolerance in crop species.

The host lab recently identified an Endoplasmic reticulum (ER) autophagy receptor C53, that interacts with ATG8 via non-canonical shuffled ATG8 interacting motif. Besides, C53 is regulated by an enigmatic posttranslational modification called ufmylation through binding to another ubiquitin-like protein UFM1. Interestingly, ATG8-UFM1 interaction is mutually exclusive. However, the structural basis of C53-ATG8 or C53-UFM1 interaction are currently unknown. Also, the physiological roles of ufmylation and the ufmylated protein substrates have not been studied in plants.

In this proposal, I aim to structurally and genetically characterize C53-ATG8 and C53-UFM1 interaction. In parallel, using proteomics, I will determine the ufmylome, i.e. ufmylated protein catalogue in plants for the first time. Finally, I will move beyond model species Arabidopsis and establish autophagy and ufmylation studies in rice. Altogether, my studies will further our understanding of a novel ER quality control pathway in model plant species and beyond.

I will work at the Gregor Mendel Institute (GMI), Vienna BioCenter (VBC) in the lab of Yasin Dagdas. VBC is one of the largest life sciences hubs in Europe. It has a dynamic postdoc community, with structured training programs to prepare postdocs for independent careers. The cutting-edge research concepts, resources, and soft-skill training that I will gain will help me to establish my own lab.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2020

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZENBIOLOGIE GMBH
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 186 167,04
Dirección
DR BOHR GASSE 3
1030 Wien
Austria

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Región
Ostösterreich Wien Wien
Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 186 167,04
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