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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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The role of genetic redundancy in adaptive evolution of efflux pumps

Descripción del proyecto

Redundancia genética y evolución de las bombas de expulsión en «Escherichia coli»

En la redundancia genética, varios genes efectúan la misma función o una función similar. Esto puede proporcionar un beneficio adaptativo durante la evolución al aumentar la dosificación de genes y proteger a los genes fundamentales de mutaciones malignas. Estos efectos adaptativos han sido confirmados experimentalmente, pero sus consecuencias a largo plazo para la evolución todavía no se han analizado. El proyecto EGR, financiado con fondos europeos, abordará esta brecha del conocimiento mediante la manipulación del contenido genómico de los genes de bombas de expulsión en «E. coli» y el análisis del efecto de su redundancia por medio de la evolución directa de proteínas. Comparará las trayectorias evolutivas a través del análisis exhaustivo de la secuencia y la adaptación de las variantes de bombas de expulsión evolucionadas y analizará directamente el papel de la redundancia genética en la evolución a fin de comprender por qué se conserva en un genoma.

Objetivo

In genetic redundancy, multiple genes in a genome perform the same or similar function. Although redundancy is widespread across the tree of life, its evolutionary origins are not entirely understood. Genetic redundancy may provide a fitness benefit during evolution by increasing gene dosage and protecting critical genes from deleterious mutations. These fitness effects have been confirmed experimentally, but their long-term consequences for evolution have not been tested. In this study, I will manipulate the genomic content of efflux pump genes in E. coli and test the effect of their redundancy using directed evolution of proteins. By evolving the multidrug efflux pump AcrAB at different levels of redundancy, I will determine how the presence of other genes with overlapping drug-efflux activities affects adaptive evolution. I will compare evolutionary trajectories using comprehensive sequence and fitness analysis of the evolved efflux pump variants. This approach will provide a unique opportunity to directly test the role of genetic redundancy in evolution and help to understand why genetic redundancy is maintained in a genome.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2020

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Coordinador

UNIVERSITAT ZURICH
Aportación neta de la UEn
€ 191 149,44
Dirección
RAMISTRASSE 71
8006 Zurich
Suiza
Región
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 191 149,44