Opis projektu
Redundancja genetyczna a ewolucja pomp efflux u bakterii E. coli
Obecność redundancji genetycznej oznacza, że wiele genów pełni tę samą lub podobną funkcję, co może przynosić korzyści podczas ewolucji poprzez zwiększanie liczby kopii danego genu i ochronę kluczowych genów przed szkodliwymi mutacjami. Zjawisko to zostało potwierdzone w drodze badań naukowych, ale nadal niewiele wiadomo na temat jego długotrwałego wpływu na ewolucję. Zespół finansowanego przez UE projektu EGR wypełni tę lukę w wiedzy, modyfikując zawartość genów pomp efflux u bakterii E. coli i badając skutki ich redundancji z wykorzystaniem ukierunkowanej ewolucji białek. Badacze porównają trajektorie ewolucyjne przy użyciu kompleksowej analizy sekwencji i kondycji powstałych wariantów pomp efflux oraz bezpośrednio zbada rolę redundancji genetycznej w ewolucji, aby zrozumieć, dlaczego jest ona utrzymywana w genomie.
Cel
In genetic redundancy, multiple genes in a genome perform the same or similar function. Although redundancy is widespread across the tree of life, its evolutionary origins are not entirely understood. Genetic redundancy may provide a fitness benefit during evolution by increasing gene dosage and protecting critical genes from deleterious mutations. These fitness effects have been confirmed experimentally, but their long-term consequences for evolution have not been tested. In this study, I will manipulate the genomic content of efflux pump genes in E. coli and test the effect of their redundancy using directed evolution of proteins. By evolving the multidrug efflux pump AcrAB at different levels of redundancy, I will determine how the presence of other genes with overlapping drug-efflux activities affects adaptive evolution. I will compare evolutionary trajectories using comprehensive sequence and fitness analysis of the evolved efflux pump variants. This approach will provide a unique opportunity to directly test the role of genetic redundancy in evolution and help to understand why genetic redundancy is maintained in a genome.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałka
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia ewolucyjna
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykamutacja
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
8006 Zurich
Szwajcaria