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Quantification of information flow in a cell signaling pathway

Projektbeschreibung

Quantifizierung der zwischen Umwelt und Zelle übertragenen Informationen

Bei Signalwegen handelt es sich um Kaskaden aus biochemischen Reaktionen, die Signale von außen in das Zellinnere weiterleiten. Ziel des im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen finanzierten Projekts Cellinfo ist zu klären, wie viele Informationen über Signalwege von der Umwelt an die Zelle übertragen und wie die Signale im Lauf der Zeit integriert werden. Das Projekt setzt modernste quantitative Optogenetik und theoretische Modellierung ein, um den Informationsfluss über den gut erforschten Mitogen-aktivierten Proteinkinase-Signalweg quantitativ zu bestimmen. Dieser Signalweg wird durch gezielte Stimulation aktiviert und die Reaktion am Ende der Signalkaskade gemessen. Die gesammelten Daten werden unter Einsatz der statistischen Physik und Informationstheorie in einen theoretischen Rahmen eingeordnet, um die Menge der übertragenen statischen und dynamischen Informationen zu quantifizieren.

Ziel

Signaling pathways are cascades of biochemical reactions that transduce environmental signals to the cell interior. The cells rely on the information transduced through signalling pathways to govern biological functions and maximise the fitness of the organism. Conversely, defects in the signalling pathways are implicated in various diseases, e.g. carcinogenesis. The intricate network of signalling pathways indicates the existence of sophisticated information processing mechanisms, motivating the key questions of this project: How much information is transmitted from the environment through the signalling pathway? How many features of the signals are conveyed? Are signals integrated over time? To answer these questions, the project combines state of the art quantitative optogenetic experiments and theoretical modelling using information theory to quantify the information flow in the canonical MAPK signaling pathway. Experimentally, a well-defined stimulus will be applied at the beginning of the pathway while measuring the response at the end of the signaling cascade. The results will be integrated into a theoretical framework based on statistical physics and information theory to quantify how much static and dynamic information is being transmitted, offering key insights into cell function — the building blocks of living organisms — with potential application in drug design. The strong interdisciplinary nature of this project and the detailed dissemination strategy promotes collaboration between research communities of physicists and biologists, as well as reinforces information as a key concept in life sciences. The included training plan ensures the candidate will acquire skills in advanced experimental and theoretical techniques, and the two-way transfer of knowledge provides mutual benefit between the candidate and the host institution.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2020

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

INSTITUT CURIE
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 184 707,84
Adresse
RUE D ULM 26
75231 Paris
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 184 707,84
Mein Booklet 0 0