Projektbeschreibung
Senkgruben als Schlüssel zur Bewertung der Evolution von Darmmikrobiom und -virom
Das Darmmikrobiom und -virom sind Mikroorganismen im menschlichen Darmtrakt. Sie beeinflussen zentrale biologische Funktionen und fördern biologische Anpassungen. Zwischen uns Menschen und unseren mikrobiellen Partnern und ihren Viren hat im Laufe der Zeit eine Kospeziation stattgefunden. Archäologisches Material wie mumifiziertes Gewebe, Koprolithen und Zahnstein können wertvolle Informationen über unsere gemeinsame Evolutionsreise liefern. Dies ist jedoch im Maßstab und in der Auflösung von historischen Senkgruben nicht möglich. Das EU-finanzierte Projekt CessOmics wird das komplexe Mikrobiom und Virom in Sedimenten von Senkgruben untersuchen, um die Migrationen und Interaktionen dieser Gemeinschaften besser zu verstehen. Das Projekt wird dazu verschiedene molekulare Datensätze kombinieren, um die fäkalen Lipide und die bakterielle und virale DNA aus diesen historischen Senkgruben zu analysieren und das evolvierende Darmmikrobiom und -virom zu untersuchen.
Ziel
Trillions of microorganisms, including bacteria and viruses, inhabit the human intestinal tract. This community, known as the gut microbiome and virome, profoundly impacts essential biological functions such as metabolism, immunity and behavior, and provides biological adaptations that we did not evolve on our own. While our microbial partners and their viruses have co-speciated with humans over millions of years, most of our knowledge comes from microbiome studies conducted on urban industrialized populations, while viruses have so far been the forgotten siblings of the microbiome family. How much has this gastrointestinal community diverged from its ancestral state? What was the impact of population migrations, and other critical historical transitions into our gut microbiome and virome? Archaeological materials such as mummified tissues, coprolites and dental calculus have the potential to shed light on our shared evolutionary journey, but not at the scale and resolution of historical cesspits, the focus of CessOmics. Cesspits are common, well-preserved features in archaeological sites that preserve everything from microfossils to the eggs of gut parasites. However, they have historically been overlooked as rich sources of molecular information. By analyzing the faecal lipids, bacterial and viral DNA from these historical cesspits, CessOmics will dive deep into the complex microbiome and virome preserved in cesspit sediments to illuminate the migrations and interactions of communities, examining their evolving gut microbiome and virome. By combining multiple molecular records that encompass the bacterial and viral fractions, we stand on the edge of a potential breakthrough in our ability to explore the evolution of the human gut community.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenMikrobiologieBakteriologie
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikDNS
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1165 Kobenhavn
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