Description du projet
Modélisation de l’évolution et de l’adaptation à l’aide de l’ADN ancien de la renouée du Japon
Les espèces invasives peuvent servir de modèles pour étudier l’évolution et l’adaptation rapides, la colonisation des espèces et le changement climatique. De nombreuses questions subsistent concernant la dynamique éco-évolutive des espèces invasives et les processus évolutifs opérant aux différents stades de la propagation et de l’invasion des espèces. Le projet CloneInvasion, financé par l’UE, étudiera le complexe d’espèces invasives de la renouée du Japon afin de mieux comprendre la colonisation des espèces et l’expansion de leur aire de répartition. En combinant l’ADN ancien des collections d’herbiers avec les technologies de séquençage de l’ADN à haut débit et la bioinformatique, l’initiative étudiera les transitions et les facteurs clés de la colonisation des plantes, l’expansion de l’aire de répartition et les capacités d’invasion dans l’espace et le temps. CloneInvasion étudiera également le rôle et les implications de l’hybridation et de la variation de la ploïdie dans la colonisation et l’invasion des plantes et identifiera la présence de régions génomiques.
Objectif
Invasive species are one of the major threats to the biodiversity on Earth but despite their bad reputation, they are also essential models for studying rapid evolution and adaptation, species colonization and climate change. Although great progress has been made in many areas of invasion ecology, there are still many open questions about the eco-evolutionary dynamics of invasive species and the evolutionary processes operating at different stages of species spread and invasion. I propose to study the invasive Japanese knotweed species complex to understand species colonization and range expansion by combining museomic (ancient DNA) from herbarium collections with high-throughput DNA sequencing technologies and bioinformatics. Specifically, I will compare data from historical and contemporary individuals to study (1) key transitions and drivers of plant colonization, range expansion, and invasion abilities, across space and time, (2) the role and implications of hybridization and ploidy variation in plant colonization and invasion and (3) identify the presence of genomic regions under selection.
Champ scientifique
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsDNA
- natural sciencesbiological sciencesevolutionary biology
- natural sciencesbiological sciencesecologyecosystems
- natural sciencesbiological sciencesecologyinvasive species
- natural sciencesearth and related environmental sciencesatmospheric sciencesclimatologyclimatic changes
Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
72074 Tuebingen
Allemagne