Description du projet
De nouveaux modèles pour dévoiler la dynamique des chromatides sœurs
La cohésion des chromatides sœurs fait référence au processus par lequel elles s’associent et se maintiennent unies pendant certaines phases du cycle cellulaire. Leur organisation et leur contribution aux fonctions cellulaires restent difficiles à appréhender dû au manque de techniques appropriés capables de distinguer leurs séquences identiques. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet MisterCHROM s’appuiera sur une technique récente et efficace qui a permis, pour la première fois, l’analyse génomique des interactions entre chromatides sœurs. Il prévoit notamment de développer des modèles théoriques pour mieux comprendre les profils de contact sensibles aux complexes chromatides sœurs et les mécanismes à l’origine de la formation et du maintien de la cohésion des chromatides sœurs.
Objectif
The proposed project aims at modeling the structure and mechanisms of sister chromatids cohesion, and how it coordinates with intra-chromatid organization to shape replicated human chromosomes and support fundamental biological mechanisms. Indeed, sister chromatids organisation and its contribution to cellular functions remained elusive due to the lack of appropriate techniques able to distinguish the identical sequences of sister chromatids. The recent development of sister-chromatid-sensitive Hi-C (scsHi-C) technique by Gerlich's group at the host institution enables, for the first time, genome-wide analysis of sister chromatids interactions. These data now require theoretical models based on general physical principles to understand the complex scsHi-C contact patterns and the mechanisms underlying the formation and maintenance of sister chromatids cohesion. I will use coarse-grained polymer simulations and analytical calculations to: (i) unravel the structural and statistical features of sister chromatids organisation, e.g. how cohesive linkages distribute on the genome and the relative impact on sister chromatids conformation and alignment; (ii) understand the interplay of cohesion with dynamic intra-chromatid loops and TADs formation; (iii) predict outcomes of system perturbations on chromosome conformations and functional implications in processes such as gene expression, mitotic chromosome organisation, and DNA repair. Because the topology of sister chromatids is uncharted territory, whatever new knowledge is gained by the modeling approach proposed in this highly innovative study will constitute important contributions to long-standing open questions in the field, and will outline pathways towards new directions to pursue in future research. Given the relevance for various physiological processes, the outcomes of this project will be highly relevant for biologists from various fields, as well as biophysicist. The opportunity and the timing are thus unique.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles mathématiques mathématiques pures topologie
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1030 WIEN
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.