Description du projet
De nouveaux modèles pour dévoiler la dynamique des chromatides sœurs
La cohésion des chromatides sœurs fait référence au processus par lequel elles s’associent et se maintiennent unies pendant certaines phases du cycle cellulaire. Leur organisation et leur contribution aux fonctions cellulaires restent difficiles à appréhender dû au manque de techniques appropriés capables de distinguer leurs séquences identiques. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet MisterCHROM s’appuiera sur une technique récente et efficace qui a permis, pour la première fois, l’analyse génomique des interactions entre chromatides sœurs. Il prévoit notamment de développer des modèles théoriques pour mieux comprendre les profils de contact sensibles aux complexes chromatides sœurs et les mécanismes à l’origine de la formation et du maintien de la cohésion des chromatides sœurs.
Objectif
The proposed project aims at modeling the structure and mechanisms of sister chromatids cohesion, and how it coordinates with intra-chromatid organization to shape replicated human chromosomes and support fundamental biological mechanisms. Indeed, sister chromatids organisation and its contribution to cellular functions remained elusive due to the lack of appropriate techniques able to distinguish the identical sequences of sister chromatids. The recent development of sister-chromatid-sensitive Hi-C (scsHi-C) technique by Gerlich's group at the host institution enables, for the first time, genome-wide analysis of sister chromatids interactions. These data now require theoretical models based on general physical principles to understand the complex scsHi-C contact patterns and the mechanisms underlying the formation and maintenance of sister chromatids cohesion. I will use coarse-grained polymer simulations and analytical calculations to: (i) unravel the structural and statistical features of sister chromatids organisation, e.g. how cohesive linkages distribute on the genome and the relative impact on sister chromatids conformation and alignment; (ii) understand the interplay of cohesion with dynamic intra-chromatid loops and TADs formation; (iii) predict outcomes of system perturbations on chromosome conformations and functional implications in processes such as gene expression, mitotic chromosome organisation, and DNA repair. Because the topology of sister chromatids is uncharted territory, whatever new knowledge is gained by the modeling approach proposed in this highly innovative study will constitute important contributions to long-standing open questions in the field, and will outline pathways towards new directions to pursue in future research. Given the relevance for various physiological processes, the outcomes of this project will be highly relevant for biologists from various fields, as well as biophysicist. The opportunity and the timing are thus unique.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- sciences naturellesmathématiquesmathématiques purestopologie
- sciences naturellessciences chimiquesscience des polymères
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquechromosome
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquegénome
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
Voir d’autres projets de cet appelRégime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1030 Wien
Autriche