Descrizione del progetto
Nuovi modelli per chiarire le dinamiche dei cromatidi fratelli
Per coesione dei cromatidi fratelli s’intende il processo con cui essi vengono accoppiati e tenuti insieme durante determinate fasi del ciclo cellulare. La loro organizzazione e il loro contributo alle funzioni cellulari non sono finora stati compresi a causa della mancanza di tecniche appropriate in grado di distinguere le loro sequenze identiche. Il progetto MisterCHROM, finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, trarrà profitto dalla recente tecnica di successo che ha permesso per la prima volta un’analisi dell’intero genoma delle interazioni di cromatidi fratelli. In particolare, intende sviluppare modelli teorici per comprendere meglio i complessi schemi di contatto sensibili ai cromatidi fratelli e i meccanismi alla base della formazione e del mantenimento della coesione dei cromatidi fratelli.
Obiettivo
The proposed project aims at modeling the structure and mechanisms of sister chromatids cohesion, and how it coordinates with intra-chromatid organization to shape replicated human chromosomes and support fundamental biological mechanisms. Indeed, sister chromatids organisation and its contribution to cellular functions remained elusive due to the lack of appropriate techniques able to distinguish the identical sequences of sister chromatids. The recent development of sister-chromatid-sensitive Hi-C (scsHi-C) technique by Gerlich's group at the host institution enables, for the first time, genome-wide analysis of sister chromatids interactions. These data now require theoretical models based on general physical principles to understand the complex scsHi-C contact patterns and the mechanisms underlying the formation and maintenance of sister chromatids cohesion. I will use coarse-grained polymer simulations and analytical calculations to: (i) unravel the structural and statistical features of sister chromatids organisation, e.g. how cohesive linkages distribute on the genome and the relative impact on sister chromatids conformation and alignment; (ii) understand the interplay of cohesion with dynamic intra-chromatid loops and TADs formation; (iii) predict outcomes of system perturbations on chromosome conformations and functional implications in processes such as gene expression, mitotic chromosome organisation, and DNA repair. Because the topology of sister chromatids is uncharted territory, whatever new knowledge is gained by the modeling approach proposed in this highly innovative study will constitute important contributions to long-standing open questions in the field, and will outline pathways towards new directions to pursue in future research. Given the relevance for various physiological processes, the outcomes of this project will be highly relevant for biologists from various fields, as well as biophysicist. The opportunity and the timing are thus unique.
                                Campo scientifico (EuroSciVoc)
                                                                                                            
                                            
                                            
                                                CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
                                                
                                            
                                        
                                                                                                
                            CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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                                        Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
                                        
                                    
                                
                            
                            
                        Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
            Programma(i)
            
              
              
                Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
                
              
            
          
                      Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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                  H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
                                      PROGRAMMA PRINCIPALE
                                    
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                  H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
                                    
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            Argomento(i)
            
              
              
                Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
                
              
            
          
                      
                  Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
            Meccanismo di finanziamento
            
              
              
                Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
                
              
            
          
                      Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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              Invito a presentare proposte
                
                  
                  
                    Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
                    
                  
                
            
                          Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1030 WIEN
Austria
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.
 
           
        