Descripción del proyecto
Desvelar el papel de la cohesina en la compactación del ADN
Las células eucariotas diploides contienen unos seis mil millones de pares de bases de ADN, cuya longitud alcanza los dos metros. Para caber en el núcleo, el ADN se asocia con proteínas histonas y se comprime en fibras de cromatina y, a pesar de ello, logra llevar a cabo los procesos de replicación y transcripción. El proyecto mcMINFLUX, financiado con fondos europeos, está interesado en comprender el papel de la proteína cohesina, cuya función se sabe que consiste en mantener unidas a las cromátidas hermanas, en la compactación del ADN. Con el objetivo de estudiar la dinámica de la cohesina, los investigadores emplearán el método de nanoscopia MINFLUX, capaz de proporcionar una resolución nanométrica en células vivas. Los resultados permitirán mejorar nuestro conocimiento sobre la transcripción, la replicación y la condensación del ADN.
Objetivo
The DNA contained in each of our cells has a size of about 2 m and is fitted into the nucleus which is about six orders of magnitude smaller. It is unclear, how this extraordinary compaction is achieved and how the cell can still carry out highly regulated processes like gene expression, DNA replication, and DNA repair in such a dense environment.
Cohesin is a protein that has been shown to play an important part in DNA compaction, especially in sister-chromatid cohesion. Recently, it has been observed that cohesin extrudes loops of DNA to achieve compaction, but how exactly it carries out its function is unknown.
Fluorescence spectroscopy is a powerful tool to investigate conformational dynamics of biomolecules. MINFLUX is a recently developed method which localizes single molecules with a precision of a few nanometers. Here, I propose a new method based on MINFLUX which will allow to track fluorescent labels on large bio-molecular complexes with nanometer spatial and millisecond time resolution. The method will be used to study conformational dynamics of cohesin in vitro and investigate the mechanism of loop extrusion.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
1030 Wien
Austria