Description du projet
Mettre au jour le rôle de la cohésine dans le compactage de l’ADN
Les cellules eucaryotes diploïdes contiennent environ 6 milliards de paires de bases d’ADN qui atteignent une longueur de plus de 2 m de long. Pour tenir dans le noyau, l’ADN s’associe à des protéines histones et se comprime en fibres de chromatine, sans pour autant que cela ne nuise à sa réplication et à sa transcription. Le projet mcMINFLUX, financé par l’UE, cherche à comprendre le rôle que la protéine cohésine, réputée pour maintenir les chromatides sœurs ensemble, joue dans le compactage de l’ADN. Pour étudier la dynamique de la cohésine, les chercheurs emploieront la méthode de nanoscopie MINFLUX, qui offre une résolution nanométrique dans les cellules vivantes. Les résultats feront progresser nos connaissances sur la condensation, la réplication et la transcription de l’ADN.
Objectif
The DNA contained in each of our cells has a size of about 2 m and is fitted into the nucleus which is about six orders of magnitude smaller. It is unclear, how this extraordinary compaction is achieved and how the cell can still carry out highly regulated processes like gene expression, DNA replication, and DNA repair in such a dense environment.
Cohesin is a protein that has been shown to play an important part in DNA compaction, especially in sister-chromatid cohesion. Recently, it has been observed that cohesin extrudes loops of DNA to achieve compaction, but how exactly it carries out its function is unknown.
Fluorescence spectroscopy is a powerful tool to investigate conformational dynamics of biomolecules. MINFLUX is a recently developed method which localizes single molecules with a precision of a few nanometers. Here, I propose a new method based on MINFLUX which will allow to track fluorescent labels on large bio-molecular complexes with nanometer spatial and millisecond time resolution. The method will be used to study conformational dynamics of cohesin in vitro and investigate the mechanism of loop extrusion.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturellessciences biologiquesgénétiqueADN
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Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1030 Wien
Autriche