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The sympatric lifestyle of giant viruses: contact tracing and fitness through mobile genetic elements

Description du projet

Étudier l’écologie des virus géants grâce aux éléments génétiques mobiles

Les virus géants, dont la taille est semblable à celle des bactéries, infectent un vaste éventail d’organismes eucaryotes unicellulaires. Ces organismes contiennent de grands génomes d’ADN et un ensemble particulier d’éléments génétiques mobiles (EGM) qui pourraient être bénéfiques pour les virus géants. Financé par le Conseil européen de la recherche, le projet CHIMERA a pour ambition de comprendre le rôle des EGM dans l’évolution et l’écologie des virus géants. Les chercheurs examineront l’hypothèse selon laquelle les EGM sont profitables aux virus dans des configurations environnementales spécifiques, par exemple lorsqu’ils sont en concurrence directe avec des bactéries qui infectent les mêmes hôtes. Le projet étudiera également la distribution des EGM dans les écosystèmes naturels en vue de faire la lumière sur les interactions entre les virus, les bactéries et les hôtes.

Objectif

"Giant viruses appear to be ubiquitous in soil and aquatic environments, infecting a wide range of protist hosts. As lytic viruses, they are important regulators in nutrient and energy cycles and key influencers of microbial community composition. The recent discovery of giant viruses challenged previous assumptions and blurred the sharp division between viruses and cellular life. Besides large particle sizes, giant viruses possess complex ""chimeric"" genomes, including genes that were likely acquired from their hosts and bacteria that parasitise the same hosts. Unique is the presence of prokaryotic-like mobile genetic elements (MGEs) that are speculated to aid giant viruses in defence against the host immune system or in direct competition for resources with other viruses or bacteria. Contrarily, bacteria may use MGEs to help the hosts counteract viral infections. Our current knowledge on the factors promoting giant virus diversity and maintenance of the virus-host balance in nature, are largely unknown. In the proposed project, I will investigate the role of MGEs in the evolution and ecology of giant viruses. I postulate that the presence of MGEs plays a crucial role in the competition between giant viruses and other parasites infecting the same hosts. Using co-infection experiments, as well as cutting-edge molecular, microscopy, and sequencing techniques, I will investigate viral competitive fitness as well as physical and molecular interactions between selected partners. By developing a highly specific giant virus genome editing tool, I will rigorously test whether MGEs can provide giant viruses with higher fitness. Moreover, I will combine cell sorting with metagenome analysis of two selected habitats, to unravel how MGEs are distributed in a natural ecosystem. My overarching goal is to elucidate the molecular dialogue between viruses, bacteria, and their hosts, and to use MGEs as a tool to trace the evolutionary history of this unique group of viruses."

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2021-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

UNIVERSITAT WIEN
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 499 899,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 499 899,00

Bénéficiaires (1)

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