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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Elucidating the interplay between nuclear compartments and transcriptional dynamics during differentiation

Descripción del proyecto

Estudiar el desarrollo de los mamíferos con células madre

El desarrollo de los mamíferos es un proceso extraordinariamente complejo pero poco conocido que está controlado, en gran medida, por genes y redes de regulación genética. El objetivo del proyecto DynaDiff, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, es dilucidar las complejidades de este proceso al investigar el papel de los orgánulos sin membrana del nucleoplasma en la dinámica transcripcional durante la diferenciación de células madre de mamíferos. Su equipo caracterizará la dinámica transcripcional de células madre murinas y humana a través de la secuenciación de ARN de célula única. A continuación, examinará el papel de los cuerpos nucleares de la leucemia promielocítica y las motas nucleares en la dinámica transcripcional de estas células pluripotentes y su efecto en la organización de la estructura de la cromatina. Esta investigación proporcionará información fundamental sobre el desarrollo humano y podría contribuir a los tratamientos médicos regenerativos y del desarrollo.

Objetivo

Development is driven by transcriptional programs where specific gene regulatory networks (GRN) control genes on several time scales. However, the extent to which transcriptional dynamics are coordinated for different genes and how the differential downregulation of the progenitor GRN determines cell fate remains poorly understood. This in part due to the difficulty of measuring genome-wide transcription with temporal resolution in complex developmental systems. Plus, transcription occurs in the nuclear context, where the nucleoplasm is compartmentalized into a variety of highly dynamic condensates known as membraneless organelles (MLOs), which include nucleoli, PML (promyelocytic leukaemia) nuclear bodies (PML-NBs), and nuclear speckles (NSs). The homeostasis of these MLOs changes during differentiation, but their impact on transcription and lineage commitment remains elusive. In DynaDiff, I aim to investigate the link between PML-NBs and NSs and transcriptional regulation during mammalian differentiation by: 1) developing single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) methods to characterize transcriptional dynamics in mouse and human embryonic stem cells (m/hESCs) during the exit from pluripotency; 2) determining the role of PML-NBs and NSs on transcriptional dynamics during differentiation, and 3) assessing the role of PML-NBs and NSs in organizing chromatin conformation and its link to active transcription. I recently made a significant technological breakthrough, finally bringing long-awaited temporal resolution to scRNA-seq. This expertise, in combination with my background in high-throughput microscopy and computational analysis allows me to lead and conduct DynaDiff successfully. Finally, hESCs have the potential to form cell types from the three primary germ layers. Our knowledge of this system is paramount to understand human early embryonic development for the treatment of developmental disorders, and for the development of regenerative medicine.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2021-STG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

HELMHOLTZ ZENTRUM MUENCHEN DEUTSCHES FORSCHUNGSZENTRUM FUER GESUNDHEIT UND UMWELT GMBH
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 1 498 372,00
Dirección
INGOLSTADTER LANDSTRASSE 1
85764 Neuherberg
Alemania

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Región
Bayern Oberbayern München, Landkreis
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 1 498 372,00

Beneficiarios (1)

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