Coding for DNA Storage

Informations projet

DNAStorage

N° de convention de subvention: 101045114

DOI

10.3030/101045114

Date de signature de la CE 10 Mai 2022

Date de début 1 Juin 2022

Date de fin 31 Mai 2027

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 096,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 096,00

Coordonné par

TECHNION - ISRAEL INSTITUTE OF TECHNOLOGY
Israel

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (5)

Error-Correcting Codes for Nanopore Sequencing

Auteurs: Anisha Banerjee; Yonatan Yehezkeally; Antonia Wachter-Zeh; Eitan Yaakobi
Publié dans: IEEE Transactions on Information Theory, 2024, ISSN 1557-9654
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/TIT.2024.3380615

Scientific Reports

Auteurs: Omer Sabary, Alexander Yucovich, Guy Shapira, Eitan Yaakobi
Publié dans: Scientific Reports, 2024, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s41598-024-51730-3

Sequence Design and Reconstruction Under the Repeat Channel in Enzymatic DNA Synthesis

Auteurs: Roy Shafir; Omer Sabary; Leon Anavy; Eitan Yaakobi; Zohar Yakhini
Publié dans: IEEE Transactions on Communications, 2023, ISSN 1558-0857
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/TCOMM.2023.3330848

GradHC: highly reliable gradual hash-based clustering for DNA storage systems

Auteurs: Dvir Ben Shabat, Adar Hadad, Avital Boruchovsky, Eitan Yaakobi
Publié dans: Bioinformatics, 2024, ISSN 1367-4811
Éditeur: Bioinformatics
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae274

Bee Identification Problem for DNA Strands

Auteurs: Johan Chrisnata, Han Mao Kiah, Alexander Vardy , and Eitan Yaakobi
Publié dans: IEEE Journal on Selected Areas in Information Theory, 2023, ISSN 2641-8770
Éditeur: IEEE Journal on Selected Areas in Information Theory
DOI: 10.1109/JSAIT.2023.3294423

Conference proceedings (7)

On the Capacity of DNA Labeling

Auteurs: Dganit Hanania; Daniella Bar-Lev; Yevgeni Nogin; Yoav Shechtman; Eitan Yaakobi
Publié dans: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Éditeur: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT)
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206769

DNA-Correcting Codes: End-to-end Correction in DNA Storage Systems

Auteurs: Avital Boruchovsky; Daniella Bar-Lev; Eitan Yaakobi
Publié dans: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.1020653610.1109/ISIT54713.2023.10206536

Cover Your Bases: How to Minimize the Sequencing Coverage in DNA Storage Systems

Auteurs: Daniella Bar-Lev; Omer Sabary; Ryan Gabrys; Eitan Yaakobi
Publié dans: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206882

DNA Synthesis Using Shortmers

Auteurs: Maria Abu-Sini; Andreas Lenz; Eitan Yaakobi
Publié dans: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206609

Coding for IBLTs with Listing Guarantees

Auteurs: Daniella Bar-Lev; Avi Mizrahi; Tuvi Etzion; Ori Rottenstreich; Eitan Yaakobi
Publié dans: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206563

On the Intersection of Multiple Insertion (or Deletion) Balls and its Application to List Decoding Under the Reconstruction Model

Auteurs: Maria Abu-Sini; Eitan Yaakobi
Publié dans: IEEE Transactions on Information Theory, 2023, ISSN 1557-9654
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/TIT.2023.3319608

Data-Driven Bee Identification for DNA Strands

Auteurs: Shubhransh Singhvi; Avital Boruchovsky; Han Mao Kiah; Eitan Yaakobi
Publié dans: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Éditeur: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT)
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206637