Coding for DNA Storage

Projektinformationen

DNAStorage

ID Finanzhilfevereinbarung: 101045114

DOI 10.3030/101045114

EK-Unterschriftsdatum 10 Mai 2022

Startdatum 1 Juni 2022

Enddatum 31 Mai 2027

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 999 096,00

EU-Beitrag € 1 999 096,00

Koordiniert durch

TECHNION - ISRAEL INSTITUTE OF TECHNOLOGY
Israel

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Veröffentlichungen

Fachlich begutachtete Artikel (5)

Error-Correcting Codes for Nanopore Sequencing

Autoren: Anisha Banerjee; Yonatan Yehezkeally; Antonia Wachter-Zeh; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Information Theory, 2024, ISSN 1557-9654
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/TIT.2024.3380615

Scientific Reports

Autoren: Omer Sabary, Alexander Yucovich, Guy Shapira, Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s41598-024-51730-3

Sequence Design and Reconstruction Under the Repeat Channel in Enzymatic DNA Synthesis

Autoren: Roy Shafir; Omer Sabary; Leon Anavy; Eitan Yaakobi; Zohar Yakhini
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Communications, 2023, ISSN 1558-0857
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/TCOMM.2023.3330848

GradHC: highly reliable gradual hash-based clustering for DNA storage systems

Autoren: Dvir Ben Shabat, Adar Hadad, Avital Boruchovsky, Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2024, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Bioinformatics
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae274

Bee Identification Problem for DNA Strands

Autoren: Johan Chrisnata, Han Mao Kiah, Alexander Vardy , and Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: IEEE Journal on Selected Areas in Information Theory, 2023, ISSN 2641-8770
Herausgeber: IEEE Journal on Selected Areas in Information Theory
DOI: 10.1109/JSAIT.2023.3294423

Konferenzprotokolle (7)

On the Capacity of DNA Labeling

Autoren: Dganit Hanania; Daniella Bar-Lev; Yevgeni Nogin; Yoav Shechtman; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Herausgeber: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT)
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206769

DNA-Correcting Codes: End-to-end Correction in DNA Storage Systems

Autoren: Avital Boruchovsky; Daniella Bar-Lev; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.1020653610.1109/ISIT54713.2023.10206536

Cover Your Bases: How to Minimize the Sequencing Coverage in DNA Storage Systems

Autoren: Daniella Bar-Lev; Omer Sabary; Ryan Gabrys; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206882

DNA Synthesis Using Shortmers

Autoren: Maria Abu-Sini; Andreas Lenz; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206609

Coding for IBLTs with Listing Guarantees

Autoren: Daniella Bar-Lev; Avi Mizrahi; Tuvi Etzion; Ori Rottenstreich; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206563

On the Intersection of Multiple Insertion (or Deletion) Balls and its Application to List Decoding Under the Reconstruction Model

Autoren: Maria Abu-Sini; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Information Theory, 2023, ISSN 1557-9654
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/TIT.2023.3319608

Data-Driven Bee Identification for DNA Strands

Autoren: Shubhransh Singhvi; Avital Boruchovsky; Han Mao Kiah; Eitan Yaakobi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2023, ISSN 2157-8117
Herausgeber: 2023 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT)
DOI: 10.1109/ISIT54713.2023.10206637