Computational Microscopy of Cells

Informations projet

COMP-O-CELL

N° de convention de subvention: 101053661

DOI

10.3030/101053661

Date de signature de la CE 25 Mai 2022

Date de début 1 Septembre 2022

Date de fin 31 Août 2027

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 498 148,00

Contribution de l’UE

€ 2 498 148,00

Coordonné par

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Netherlands

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (6)

Bartender: Martini 3 Bonded Terms via Quantum Mechanics-based Molecular Dynamics

Auteurs: Gilberto P. Pereira; Riccardo Alessandri; Moisés Domínguez; Rocío Araya-Osorio; Linus Grünewald; Luís Borges-Araújo; Sangwook Wu; Siewert J. Marrink; Paulo C. T. Souza; Raul Mera-Adasme
Publié dans: JCTC, 2024, ISSN 1549-9626
Éditeur: ACS
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-62kh1-v2

Dynamics of chromosome organization in a minimal bacterial cell

Auteurs: Benjamin R. Gilbert; Zane R. Thornburg; Troy A. Brier; Jan A. Stevens; Fabian Grünewald; John E. Stone; John E. Stone; Siewert J. Marrink; Zaida Luthey-Schulten; Zaida Luthey-Schulten; Zaida Luthey-Schulten
Publié dans: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Vol 11 (2023), 2023, ISSN 2296-2646
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.1016/j.bpj.2023.11.1996

Martini 3 Coarse-Grained Force Field for Cholesterol

Auteurs: Luís Borges-Araújo; Ana C. Borges-Araújo; Tugba Nur Ozturk; Daniel P. Ramirez-Echemendia; Balázs Fábián; Timothy S. Carpenter; Sebastian Thallmair; Jonathan Barnoud; Helgi I. Ingólfsson; Gerhard Hummer; D. Peter Tieleman; Siewert J. Marrink; Paulo C. T. Souza; Manuel N. Melo
Publié dans: "Journal of Chemical Theory and Computation, 2023, 19 (20), pp.7387-7404. ⟨10.1021/acs.jctc.3c00547⟩", 2023, ISSN 1549-9626
Éditeur: ACS
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-lh7bq

Automatic Optimization of Lipid Models in the Martini Force Field Using <i>SwarmCG</i>

Auteurs: Charly Empereur-mot; Kasper B. Pedersen; Riccardo Capelli; Martina Crippa; Cristina Caruso; Mattia Perrone; Paulo C. T. Souza; Siewert J. Marrink; Giovanni M. Pavan
Publié dans: JCIM, 2023, ISSN 1549-9626
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acs.jcim.3c00530

Molecular dynamics simulation of an entire cell

Auteurs: Stevens et al.
Publié dans: Frontiers in Chemistry, 2023, ISSN 2296-2646
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fchem.2023.1106495

Pragmatic Coarse-Graining of Proteins: Models and Applications

Auteurs: Borges-Araújo, Luís; Patmanidis, Ilias; Singh, Akhil P.; Santos, Lucianna H. S.; Sieradzan, Adam K.; Vanni, Stefano; Czaplewski, Cezary; Pantano, Sergio; Shinoda, Wataru; Monticelli, Luca; Liwo, Adam; Marrink, Siewert J.; Souza, Paulo C. T.
Publié dans: JCTC, 2023, ISSN 1549-9626
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acs.jctc.3c00733