Computational Microscopy of Cells

Projektinformationen

COMP-O-CELL

ID Finanzhilfevereinbarung: 101053661

DOI 10.3030/101053661

EK-Unterschriftsdatum 25 Mai 2022

Startdatum 1 September 2022

Enddatum 31 August 2027

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 2 498 148,00

EU-Beitrag € 2 498 148,00

Koordiniert durch

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Niederlande

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Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Datenmanagementplan (1)

Data Management Plan

Drafting of Data Management Plan

Veröffentlichungen

Fachlich begutachtete Artikel (6)

Bartender: Martini 3 Bonded Terms via Quantum Mechanics-based Molecular Dynamics

Autoren: Gilberto P. Pereira; Riccardo Alessandri; Moisés Domínguez; Rocío Araya-Osorio; Linus Grünewald; Luís Borges-Araújo; Sangwook Wu; Siewert J. Marrink; Paulo C. T. Souza; Raul Mera-Adasme
Veröffentlicht in: JCTC, 2024, ISSN 1549-9626
Herausgeber: ACS
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-62kh1-v2

Dynamics of chromosome organization in a minimal bacterial cell

Autoren: Benjamin R. Gilbert; Zane R. Thornburg; Troy A. Brier; Jan A. Stevens; Fabian Grünewald; John E. Stone; John E. Stone; Siewert J. Marrink; Zaida Luthey-Schulten; Zaida Luthey-Schulten; Zaida Luthey-Schulten
Veröffentlicht in: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Vol 11 (2023), 2023, ISSN 2296-2646
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.1016/j.bpj.2023.11.1996

Martini 3 Coarse-Grained Force Field for Cholesterol

Autoren: Luís Borges-Araújo; Ana C. Borges-Araújo; Tugba Nur Ozturk; Daniel P. Ramirez-Echemendia; Balázs Fábián; Timothy S. Carpenter; Sebastian Thallmair; Jonathan Barnoud; Helgi I. Ingólfsson; Gerhard Hummer; D. Peter Tieleman; Siewert J. Marrink; Paulo C. T. Souza; Manuel N. Melo
Veröffentlicht in: "Journal of Chemical Theory and Computation, 2023, 19 (20), pp.7387-7404. ⟨10.1021/acs.jctc.3c00547⟩", 2023, ISSN 1549-9626
Herausgeber: ACS
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-lh7bq

Automatic Optimization of Lipid Models in the Martini Force Field Using <i>SwarmCG</i>

Autoren: Charly Empereur-mot; Kasper B. Pedersen; Riccardo Capelli; Martina Crippa; Cristina Caruso; Mattia Perrone; Paulo C. T. Souza; Siewert J. Marrink; Giovanni M. Pavan
Veröffentlicht in: JCIM, 2023, ISSN 1549-9626
Herausgeber: ACS
DOI: 10.1021/acs.jcim.3c00530

Molecular dynamics simulation of an entire cell

Autoren: Stevens et al.
Veröffentlicht in: Frontiers in Chemistry, 2023, ISSN 2296-2646
Herausgeber: frontiers
DOI: 10.3389/fchem.2023.1106495

Pragmatic Coarse-Graining of Proteins: Models and Applications

Autoren: Borges-Araújo, Luís; Patmanidis, Ilias; Singh, Akhil P.; Santos, Lucianna H. S.; Sieradzan, Adam K.; Vanni, Stefano; Czaplewski, Cezary; Pantano, Sergio; Shinoda, Wataru; Monticelli, Luca; Liwo, Adam; Marrink, Siewert J.; Souza, Paulo C. T.
Veröffentlicht in: JCTC, 2023, ISSN 1549-9626
Herausgeber: ACS
DOI: 10.1021/acs.jctc.3c00733