Description du projet
Une approche innovante pour découvrir le spectre des mécanismes antiviraux cellulaires
Le projet Traitor-Viruses, financé par l’UE, propose une approche très innovante pour développer l’identification spécifique des mécanismes antiviraux à l’échelle du génome. Les chercheurs construiront des bibliothèques de virus-1 de l’immunodéficience humaine capables de se répliquer et exprimant des ARN guides susceptibles d’inactiver tous les gènes humains dans des cellules exprimant la caspase-9. Les variantes de la bibliothèque exprimant des ARN guides inactivant les gènes antiviraux seront sélectionnées par repiquage et identifiées par séquençage de nouvelle génération. En utilisant différentes structures virales, les chercheurs pourront découvrir les facteurs de défense contre les virus humains et animaux. Le projet déterminera le spectre des facteurs antiviraux innés qui peuvent être utilisés dans des approches préventives et thérapeutiques.
Objectif
Viruses may seem smart since they rapidly develop new skills to spread in humans. However, they are actually just masters of trial and error. Their short generation time, enormous reproduction and high variability allows viruses to try countless variations. A few of these will enhance viral spread and, in the worst case, enable viral pandemics. It is conceivable that viruses evolve to counteract those defence mechanisms that would otherwise be most effective against them. Usually, it is hard to assess why specific changes are advantageous. This is especially true for adaptations enabling viral pathogens to counteract innate antiviral factors because these cellular proteins and their viral antagonists are numerous and highly versatile. Here, I propose to combine the advantages of the revolutionary CRISPR/Cas9 technology with the enormous adaptive power of viruses to develop a novel approach allowing robust, specific and genome-wide unmasking of antiviral mechanisms. In principle, we will equip HIV-1 with genetic scissors to convert them into traitor viruses revealing their cellular opponents. To achieve this, we will generate libraries of replication-competent HIV-1 constructs expressing guide RNAs as genetic tools with the potential to inactivate every human gene in Cas9 expressing cells. Virus variants expressing guide RNAs eliminating antiviral genes will be selected by in vitro passaging and identified by next generation sequencing. Utilization of different viral backbones will allow the discovery of key defence factors against viral zoonoses and spread in humans. Finally, we will determine the antiviral spectrum and inducibility of innate antiviral factors to identify vulnerabilities of viral pathogens that can be exploited in preventive and therapeutic approaches. The project will establish and apply an innovative, highly versatile approach to uncover our antiviral defence mechanisms with the ultimate goal is to achieve better control of viral pathogens.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
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Programme(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Thème(s)
Régime de financement
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstitution d’accueil
89081 Ulm
Allemagne