Description du projet
Variation génétique et évolution du génome
Les progrès récents dans les domaines de la technologie de séquençage, du calcul et de la théorie rendent possible l’analyse de génomes haploïdes entiers à grande échelle. Le projet HaplotypeStructure, financé par l’UE, vise à développer une analyse théorique de la variation génétique étalée sur des génomes linéaires continus. Le projet sera développé à partir de données empiriques issues d’expériences de sélection artificielle et d’une étude approfondie d’une zone hybride chez les plantes du genre Antirrhinum. Les résultats de l’étude HaplotypeStructure ouvriront de nouveaux horizons à la génomique des populations, en l’élargissant au-delà de la focalisation actuelle sur les loci individuels. Le projet permettra de développer de meilleurs outils d’analyse des données de séquences d’ADN et de mieux comprendre l’évolution du génome.
Objectif
An organism's phenotype depends on a multitude of genetic variants, spread over a linear genome. This is widely understood, and yet in practice, has hardly been incorporated into population genetic analysis. Recent developments in theory, computation, and sequencing technology now make it possible to obtain and analyse whole haploid genomes on a large scale. This proposal is to develop and apply a theoretical analysis of genetic variation that is spread over continuous linear genomes. Theory and methods will be developed in close interaction with empirical data from artificial selection experiments and from an intensely studied hybrid zone in Antirrhinum; for both, we have a known pedigree, and phased whole-genome sequence. Population structure will be analysed by following blocks of genome through pedigrees, and across two-dimensional landscapes. Selection on discrete loci will be analysed by finding its effect on surrounding haplotypes, by analysing how favoured alleles become disentangled from heterogeneous backgrounds, and by seeing how haplotype blocks flow past selected clines. The contribution of variants that are spread across the genome to GWA, to selection response, and to hybrid zones will be modelled, and the overall effect of inherited fitness variance on haplotype structure will be determined. This work will establish a new framework for population genomics that goes beyond the current focus on individual loci. It will help bridge the distinct communities within genomics, quantitative genetics, and population genetics, which currently tackle these problems largely in isolation. The project will develop better tools for inferring selection and population structure from DNA sequence data, and more fundamentally, will give us a deeper understanding of how the abundant variation that is carried on linear genomes is shaped by evolution.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2021-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
3400 KLOSTERNEUBURG
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.