Objetivo
Cryo-electron microscopy has revolutionized the field of structural biology, primarily for macromolecular structure but also for cells and tissue sections—achieving resolutions at the limit of physical optics. While wide-field transmission EM (TEM) with phase contrast by defocus is the most commonly used modality in biology, the alternative, scanning transmission EM (STEM), has emerged as the mode of choice for atomic resolution in materials science. Seeking to endow biology with the benefits of STEM, our lab established STEM for cryo-tomography of biological cells and demonstrated its advantages for thick specimens and compositional contrast. We now seek to extend cryo-STEM to high-resolution, with an emphasis on tomography, by means of coherent detection (Obj1). This will be achieved by the method of integrated differential phase contrast (iDPC) using a segmented detector, from which we obtain simultaneously phase and depth contrast in a single scan.
The major expected benefits are: 1) minimization of image aberration, especially defocus with its associated complications for image interpretation, 2) reduction of beam-induced radiation damage by means of flexible scan and sampling patterns, and 3) improved reconstruction for tomography based on tailored data acquisition. We will validate the new methods for single particle analysis on standard macromolecular substrates and compare them to current state-of-the-art methods. Further, we will apply the new developments in 3D imaging to explore novel large-scale structures in chromatin we observed recently by whole-cell cryo-STEM tomography using current, low-resolution methods (Obj2). Labelling with halogenated nucleotides will reveal sites of active transcription or DNA synthesis.
The proposed approaches’ expected broad applicability and STEM’s unrealized potential for hardware simplicity should together ensure the wide adoption of cryo-STEM methods in biology, accelerated by our dissemination efforts (Obj3).
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias naturales ciencias biológicas genética nucleótido
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2021-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
7610001 Rehovot
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.