Description du projet
Apprendre à envisager les eaux usées comme un réservoir de résistance aux antibiotiques
Les égouts urbains abritent des communautés microbiennes complexes contenant diverses bactéries résistantes aux antibiotiques provenant des excréments humains. Le projet DEAR-Waste, financé par le programme MSCA, cherche à comprendre la dynamique des populations bactériennes résistantes aux antibiotiques dans les égouts urbains en créant des systèmes modèles d’eaux usées (microcosmes) qui reconstituent la complexité de l’environnement des eaux usées. En exploitant des connaissances interdisciplinaires et des outils analytiques comme le séquençage à haut débit et la modélisation statistique, il émulera les performances des espèces en fonction de différentes conditions chimiques et interactions interspécifiques. Ces modèles de laboratoire seront comparés à des mesures réelles effectuées dans des égouts urbains. Couplé aux résultats d’une expérience évolutive utilisant des microcosmes similaires, le projet DEAR-Waste permettra de déterminer l’effet de la complexité environnementale et des interactions interspécifiques sur l’évolution de la résistance aux antibiotiques dans les eaux usées urbaines.
Objectif
Environmental antibiotic resistance is a major threat to human and veterinary health and a key issue addressed by the European One Health Action Plan Against Antimicrobial Resistance. City sewers shelter rich and diverse bacterial communities that are continuously exposed to antibiotic residues from human excreta, thus becoming a reservoir of resistance. Predicting the risk of antibiotic resistance evolution in city sewers requires a comprehensive understanding of the dynamics and evolution of wastewater bacterial communities faced to such exposition. However, sewers are complex environments and contain multiple abiotic factors, which may act in non-additive ways. In addition, interactions between species within communities affect growth and consequently competition, through both density- and frequency-dependent processes. By changing the competitive ability of variants, such as antibiotic resistant phenotypes, interspecies interactions also change evolutionary processes.
DEAR-Waste aims at understanding the dynamics of communities and antibiotic resistance evolution in city sewers, together with establishing wastewater as a model system for fundamental studies on community dynamics and evolution. DEAR-Waste adopts an interdisciplinary approach, combining high-throughput sequencing technologies, environmental chemistry, microbial ecology and evolution, time-series statistical analysis, and formal modelling. Data from synthetic mesocosms will parametrize the Hutchinsonian niche for population in communities: a tolerance curve mapping species performance onto a complex environmental space defined by the multidimensional abiotic environment and species interactions. Predictions from these curves will be tested against field measurements of microbial and chemical dynamics sampled in city sewers. An evolutionary experiment in similar mesocosms will finally quantify how environmental complexity and interspecies interactions modulate the evolution of antibiotic resistance.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
- ingénierie et technologiegénie de l'environnementprocédés de traitement des eauxprocédés de traitement de eau usée
- sciences naturellessciences biologiquesécologie
- sciences naturellessciences biologiquesbiologie de l'évolution
- sciences médicales et de la santémédecine fondamentalepharmacologie et pharmacierésistance aux médicamentsrésistance aux antibiotiques
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Mots‑clés
Programme(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Régime de financement
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinateur
17003 Girona
Espagne